RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 DNASE1L2Q92874 299 aa7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 CLDN23Q96B33 292 aa7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 CALML4Q96GE6 196 aa7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 LRRC3Q9BY71 257 aa7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 BCO2Q9BYV7 579 aa7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 HEBP1Q9NRV9 189 aa7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa7.55□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 OR6C75A6NL08 312 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 FAM170BA6NMN3 283 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 TISP43B9A030 160 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ARNTLO00327 626 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 NFICP08651 508 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 GJA1P17302 382 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 TYMPP19971 482 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 GNALP38405 381 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 GTF2BQ00403 316 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 FZD5Q13467 585 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 GRM2Q14416 872 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 IQCEQ6IPM2 695 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 VITQ6UXI7 678 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 MYCT1Q8N699 235 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 LEMD2Q8NC56 503 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 NELL1Q92832 810 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 SMARCD2Q92925 531 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 SCYL1Q96KG9 808 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 PGLYRP2Q96PD5 576 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 TSPAN18Q96SJ8 248 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 CCSER1Q9C0I3 900 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ZFP14Q9HCL3 533 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 TRPV5Q9NQA5 729 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ASAH2Q9NR71 780 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 COL4A2P08572 1712 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 TRIP11Q15643 1979 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF292O60281 2723 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ANO9A1A5B4 782 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 MTMR11A4FU01 709 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ESPNB1AK53 854 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 TBCAO75347 108 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 CYP11A1P05108 521 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 NMT1P30419 496 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 RPS9P46781 194 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 MMP16P51512 607 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 LILRA4P59901 499 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 DUSP4Q13115 394 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 GPR17Q13304 367 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 CUL4AQ13619 759 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 MYBPC2Q14324 1141 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 PTPAQ15257 358 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 TEAD2Q15562 447 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 JADE1Q6IE81 842 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 CENPPQ6IPU0 288 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 USP49Q70CQ1 688 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 CD302Q8IX05 232 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ELMOD1Q8N336 334 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 SENP8Q96LD8 212 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM209Q96SK2 561 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 NELL2Q99435 816 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 DNAJC7Q99615 494 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTXN3-201ENST00000379445 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms