RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.65■□□□□ 0.9
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ACOT2P49753 483 aa20.64■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.64■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 RNF40O75150 1001 aa20.63■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 RNF43Q68DV7 783 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 UNC13DQ70J99 1090 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.62■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 USP25Q9UHP3 1055 aa20.62■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 GALK1P51570 392 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 NLRP12P59046 1061 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 HPS3Q969F9 1004 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHFRQ96EP1 664 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 ASB7Q9H672 318 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 IL18RAPO95256 599 aa20.6■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PROS1P07225 676 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 PDGFRLQ15198 375 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.6■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 HHIPQ96QV1 700 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.6■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 C2CD2Q9Y426 696 aa20.6■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARSAP15289 507 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 CASP1P29466 404 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAF6P49848 677 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 CREB5Q02930 508 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 CUL4BQ13620 913 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 TXNDC8Q6A555 127 aa20.59■□□□□ 0.89
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