RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355531.7

AFG3L1P-201, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AFG3L1P, Length 1,329 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-201ENST00000355531 PI4K2AQ9BTU6 479 aa15.95■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 CUEDC2Q9H467 287 aa15.95■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 L1RE1Q9UN81 338 aa15.95■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 AGAP1Q9UPQ3 857 aa15.95■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 HPSEQ9Y251 543 aa15.95■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa15.95■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 IGF2RP11717 2491 aa15.95■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 A0A087X0B3 334 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 GOLGA8IPA6NC78 632 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 GOLGA8JA6NMD2 632 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 HRO43593 1189 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 IDEP14735 1019 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 NLRP12P59046 1061 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PLCB2Q00722 1185 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 SMARCB1Q12824 385 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 OSTM1Q86WC4 334 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 MAB21L3Q8N8X9 362 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 CXorf38Q8TB03 319 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 RIN3Q8TB24 985 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 CBWD1Q9BRT8 395 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PANK2Q9BZ23 570 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 HPS4Q9NQG7 708 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 OLFML3Q9NRN5 406 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 USP25Q9UHP3 1055 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 EXOC7Q9UPT5 735 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 HCRTO43612 131 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 F11P03951 625 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PNPLA4P41247 253 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 STAT6P42226 847 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 TSPY1Q01534 308 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 BFSP1Q12934 665 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 TXNDC8Q6A555 127 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 LONP2Q86WA8 852 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 IQUBQ8NA54 791 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 NETO1Q8TDF5 533 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 CHFRQ96EP1 664 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PCIF1Q9H4Z3 704 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 MAGEF1Q9HAY2 307 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 GKN1Q9NS71 199 aa15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PTPRJQ12913 1337 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 FRMD3A2A2Y4 597 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 SLC30A4O14863 429 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 TADA3O75528 432 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PFKFB1P16118 471 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PTMSP20962 102 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 GARTP22102 1010 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 CYP2F1P24903 491 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 AVPR1AP37288 418 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 DDR2Q16832 855 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 SYCP3Q8IZU3 236 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 FSIP1Q8NA03 581 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PKMYT1Q99640 499 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 EBF3Q9H4W6 596 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PDE11AQ9HCR9 933 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 LMBRD1Q9NUN5 540 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 SIX4Q9UIU6 781 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.93■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 A0A1B0GVL5 298 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 EXTL3O43909 919 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 HUS1O60921 280 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 RETP07949 1114 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 KRT19P08727 400 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 ARSAP15289 507 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 SYKP43405 635 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 RUNX3Q13761 415 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 E2F4Q16254 413 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 LRRC52Q8N7C0 313 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 GLIS3Q8NEA6 775 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 HPS3Q969F9 1004 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 ACBD6Q9BR61 282 aa15.92■□□□□ 0.14
AFG3L1P-201ENST00000355531 TDP1Q9NUW8 608 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms