RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 SNX27Q96L92 541 aa24.11■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 TRAIPQ9BWF2 469 aa24.11■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 ANAPC5Q9UJX4 755 aa24.11■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 MYO1EQ12965 1108 aa24.1■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 GSTA5Q7RTV2 222 aa24.1■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 PRUNE1Q86TP1 453 aa24.1■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.1■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 ZWILCHQ9H900 591 aa24.1■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.1■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 TRIP11Q15643 1979 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 PPEF2O14830 753 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 KLRC2P26717 231 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 IL1R2P27930 398 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 PPP2R2AP63151 447 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 CAV1Q03135 178 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 PPARDQ03181 441 aa24.09■■□□□ 1.45
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SNX18-201ENST00000326277 SMTNL2Q2TAL5 461 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 NOTUMQ6P988 496 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 DERAQ9Y315 318 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 TLDC2A0PJX2 215 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
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SNX18-201ENST00000326277 TTC39CQ8N584 583 aa24.09■■□□□ 1.45
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SNX18-201ENST00000326277 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
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SNX18-201ENST00000326277 RSPH14Q9UHP6 348 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 SMIM23A6NLE4 172 aa24.08■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 LMNB2Q03252 620 aa24.08■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 IRF5Q13568 498 aa24.08■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB6Q15916 424 aa24.08■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 KCNT1Q5JUK3 1230 aa24.08■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24.08■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 C12orf29Q8N999 325 aa24.08■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 PGM2Q96G03 612 aa24.08■■□□□ 1.45
SNX18-201ENST00000326277 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.08■■□□□ 1.45
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SNX18-201ENST00000326277 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 HAUS1Q96CS2 278 aa24.07■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 TMEM109Q9BVC6 243 aa24.07■■□□□ 1.44
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SNX18-201ENST00000326277 KIAA1257Q9ULG3 409 aa24.07■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ZNF148Q9UQR1 794 aa24.07■■□□□ 1.44
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SNX18-201ENST00000326277 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.07■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 PWWP2AQ96N64 755 aa24.07■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 TSPYL1Q9H0U9 437 aa24.07■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 RNF19AQ9NV58 838 aa24.07■■□□□ 1.44
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SNX18-201ENST00000326277 SCN1AP35498 2009 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 PIK3R2O00459 728 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 PFKMP08237 780 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
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SNX18-201ENST00000326277 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
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SNX18-201ENST00000326277 HAS3O00219 553 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 TREHO43280 583 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 RECQL4O94761 1208 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ACSL3O95573 720 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 CYP2B6P20813 491 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 BEX3Q00994 111 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 P3H1Q32P28 736 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ALLCQ8N6M5 410 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 USP6NLQ92738 828 aa24.06■■□□□ 1.44
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SNX18-201ENST00000326277 EPN3Q9H201 632 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 MYL3P08590 195 aa24.05■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 AKAP5P24588 427 aa24.05■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 CCT5P48643 541 aa24.05■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa24.05■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 CROCCP2Q86T23 111 aa24.05■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 BEST2Q8NFU1 509 aa24.05■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 APOL6Q9BWW8 343 aa24.05■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 CNTN3Q9P232 1028 aa24.05■■□□□ 1.44
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