RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDH9Q9HC56 1237 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNF8O76064 485 aa23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 GSTA2P09210 222 aa23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 BPIFB4P59827 614 aa23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 TREML1Q86YW5 311 aa23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 PALM2Q8IXS6 379 aa23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 MCEEQ96PE7 176 aa23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 PARVAQ9NVD7 372 aa23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF212Q9UDV6 495 aa23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 IP6K2Q9UHH9 426 aa23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 MT-ND3P03897 115 aa23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 ENO1P06733 434 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHBP35232 272 aa23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGDCC3Q8IVU1 814 aa23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 TIPINQ9BVW5 301 aa23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 SCINQ9Y6U3 715 aa23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 NFASCO94856 1347 aa23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 ETV4P43268 484 aa23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 AOC3Q16853 763 aa23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 GBP5Q96PP8 586 aa23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPCSQ9HAB8 311 aa23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITGAVP06756 1048 aa23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRAF1Q13077 416 aa23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT72Q14CN4 511 aa23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 BICD1Q96G01 975 aa23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF536O15090 1300 aa23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM191CA6NGB0 347 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM63AO94886 807 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 VNN1O95497 513 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 LYNP07948 512 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM191BP0C7N4 346 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 PYGBP11216 843 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDKN2BP42772 138 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACOT2P49753 483 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 TFDP3Q5H9I0 405 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 IZUMO2Q6UXV1 221 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANO5Q75V66 913 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP37Q86T82 979 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.333e-9■■■□□ 18.7
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMX2Q9Y320 296 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP1O94782 785 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCNE2O96020 404 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 DHRS4L1P0CG22 281 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAAP100Q0VG06 881 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTMR1Q13613 665 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMTNL2Q2TAL5 461 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.337e-7■■□□□ 12.7
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAT8LQ8N9F0 302 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 SHKBP1Q8TBC3 707 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYTH2Q99418 400 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC1Q99614 292 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 GORASP1Q9BQQ3 440 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 MECRQ9BV79 373 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 KDSRQ06136 332 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 CUL2Q13617 745 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLHL38Q2WGJ6 581 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPIL6Q8IXY8 311 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC25A41Q8N5S1 370 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC35B2Q8TB61 432 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACTL9Q8TC94 416 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 LYPLA2O95372 231 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANPEPP15144 967 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 GSTT1P30711 240 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPL22P35268 128 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTK7Q13308 1070 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNT1Q5JUK3 1230 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 C4orf19Q8IY42 314 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 VCPIP1Q96JH7 1222 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 PANX3Q96QZ0 392 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 BAG2O95816 211 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 LAMB3Q13751 1172 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 DLGAP5Q15398 846 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZACNQ401N2 412 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 CFAP61Q8NHU2 1237 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 FNBP1Q96RU3 617 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPAS1Q99814 870 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms