RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 HES6Q96HZ4 224 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 PRLRP16471 622 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 BBS7Q8IWZ6 715 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 DCDC2Q9UHG0 476 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 CLCA2Q9UQC9 943 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 MTSS1O43312 755 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPN7P35236 360 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 NFIXQ14938 502 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR141Q7Z602 305 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 ADCK2Q7Z695 626 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 HERVK_113P62684 666 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 IYDQ6PHW0 289 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 GSNP06396 782 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNMA1Q12791 1236 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM83EQ2M2I3 478 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 SCUBE1Q8IWY4 988 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 RHBDL2Q9NX52 303 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 NFIBO00712 420 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 AVPR1AP37288 418 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 CUL2Q13617 745 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 FAXCQ5TGI0 409 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 SGF29Q96ES7 293 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 STIP1P31948 543 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 LINC00523Q86TU6 105 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 APPL1Q9UKG1 709 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 O00370 1275 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 ECSITQ9BQ95 431 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 EVPLLA8MZ36 301 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM69Q86WT6 500 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 CYTH3O43739 400 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 CSF1RP07333 972 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 IMPDH2P12268 514 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 ETFBP38117 255 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 POU4F1Q01851 419 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 FUT11Q495W5 492 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 HIC2Q96JB3 615 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 TBX20Q9UMR3 447 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 WBP4O75554 376 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 THRAP10827 490 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC15Q0P6D6 951 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 GRB10Q13322 594 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPAQ15257 358 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM65Q6PJ69 517 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 PACSIN1Q9BY11 444 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 MPP6Q9NZW5 540 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 CHRM3P20309 590 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 SOAT1P35610 550 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX17Q15036 470 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM245Q9H330 911 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 DDHD1Q8NEL9 900 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 C10orf88Q9H8K7 445 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC37A4O43826 429 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 TPST1O60507 370 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 TADA2AO75478 443 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 NPEPPSP55786 919 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 CRYMQ14894 314 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 MTFR1Q15390 333 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM16LQ309B1 348 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTRT1Q8TDG2 376 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GW55 424 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEB2O15479 319 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 DUX4L2P0CJ85 424 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 DUX4L3P0CJ86 424 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 DUX4L4P0CJ87 422 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 DUX4L5P0CJ88 424 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 DUX4L6P0CJ89 424 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 DUX4L7P0CJ90 424 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 DUX4Q9UBX2 424 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 RARGP13631 454 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 TGM2P21980 687 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 BTN2A2Q8WVV5 523 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 HPDLQ96IR7 371 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 AP4S1Q9Y587 144 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 GYS1P13807 737 aa25.08■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 BBS2Q9BXC9 721 aa25.08■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 L1RE1Q9UN81 338 aa25.08■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 TWF1Q12792 350 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP78Q5JTW2 689 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 HPS4Q9NQG7 708 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 GIMAP4Q9NUV9 329 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ALKQ9UM73 1620 aa25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms