RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fnip1Q68FD7 1165 aa32.25■■■□□ 2.75
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Snrnp25Q8VIK1 123 aa32.25■■■□□ 2.75
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pde2aQ922S4 916 aa32.25■■■□□ 2.75
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm3404Q9D506 307 aa32.25■■■□□ 2.75
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tcirg1Q9JHF5 834 aa32.25■■■□□ 2.75
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Syt17Q920M7 470 aa32.24■■■□□ 2.75
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ush1cQ9ES64 910 aa32.24■■■□□ 2.75
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Stk40Q7TNL3 435 aa32.23■■■□□ 2.75
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Il33Q8BVZ5 266 aa32.23■■■□□ 2.75
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa32.23■■■□□ 2.75
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rassf7Q9DD19 359 aa32.23■■■□□ 2.75
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Flt3lgP49772 232 aa32.22■■■□□ 2.75
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r213Q8R278 384 aa32.22■■■□□ 2.75
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znf394Q9Z1D9 521 aa32.22■■■□□ 2.75
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ttyh3Q6P5F7 524 aa32.21■■■□□ 2.75
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q9D454 513 aa32.21■■■□□ 2.75
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q80ZQ3 298 aa32.2■■■□□ 2.75
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gsdmc3Q8CB12 480 aa32.2■■■□□ 2.75
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klhl36Q8R124 613 aa32.2■■■□□ 2.75
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q9D9D9 101 aa32.2■■■□□ 2.75
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nkx2-4Q9EQM3 354 aa32.2■■■□□ 2.75
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sept5Q9Z2Q6 369 aa32.18■■■□□ 2.74
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prl3a1Q78Y73 227 aa32.18■■■□□ 2.74
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Npffr2Q924H0 417 aa32.18■■■□□ 2.74
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