RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA LSM8P47093 109 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
15S_rRNA15S_rRNA YPL067CQ02754 198 aa0.49□□□□□ -2.33
15S_rRNA15S_rRNA GSC2P40989 1895 aa0.48□□□□□ -2.33
15S_rRNA15S_rRNA RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
15S_rRNA15S_rRNA RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
15S_rRNA15S_rRNA SFT2P38166 215 aa0.48□□□□□ -2.33
15S_rRNA15S_rRNA EMC4P53073 190 aa0.48□□□□□ -2.33
15S_rRNA15S_rRNA DDP1Q99321 188 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
15S_rRNA15S_rRNA SUI1P32911 108 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
15S_rRNA15S_rRNA MOG1P47123 218 aa0.47□□□□□ -2.33
15S_rRNA15S_rRNA SPG1P50088 95 aa0.46□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA YDR366CP87287 132 aa0.46□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA YOR385WQ08909 290 aa0.46□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA BLM10P43583 2143 aa0.46□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA PET54P10834 293 aa0.46□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA MRPL44P19956 98 aa0.46□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA YBR013CP38215 129 aa0.46□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA YGL149WP53116 101 aa0.46□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA PFY1P07274 126 aa0.45□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA MIC27P50945 234 aa0.45□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA AIM4P38305 123 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA YMR320WQ04897 101 aa0.44□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA MED11Q99278 115 aa0.44□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA RPS1AP33442 255 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA TY4B-JP47024 1803 aa0.43□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA YOR1P53049 1477 aa0.43□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA BRP1P53194 125 aa0.42□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA YLR296WQ05898 108 aa0.42□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA HAP3P13434 144 aa0.41□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA SMD2Q06217 110 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA LDB18Q07887 179 aa0.41□□□□□ -2.34
15S_rRNA15S_rRNA YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA RPC19P28000 142 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA RBL2P48606 106 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA YGR039WP53225 103 aa0.4□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA COF1Q03048 143 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA ATP14Q12349 124 aa0.4□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA GTT2Q12390 233 aa0.4□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA SNT2P53127 1403 aa0.39□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA QCR10P37299 77 aa0.39□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA HHO1P53551 258 aa0.39□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA ARC19P33204 171 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA HSP10P38910 106 aa0.38□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA SPC3Q12133 184 aa0.38□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA YRF1-3P0CX14 1859 aa0.37□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA YRF1-7P0CX15 1859 aa0.37□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA POR2P40478 281 aa0.37□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA SDH7Q04401 133 aa0.37□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA BNI1P41832 1953 aa0.36□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA AIM18P38884 321 aa0.36□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA RTC6O14464 93 aa0.35□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA YCR050CP25630 102 aa0.35□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA GSP1P32835 219 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA PRS3P38689 320 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA EFM5P53200 248 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA YLR194CQ05777 254 aa0.35□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA PAU21P0CE86 164 aa0.35□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA PAU22P0CE87 164 aa0.35□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA YAL064WP39711 94 aa0.35□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA HPM1P40481 377 aa0.35□□□□□ -2.35
15S_rRNA15S_rRNA SRX1P36077 127 aa0.34□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA RPL14AP36105 138 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA RPL14BP38754 138 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA ELC1Q03071 99 aa0.33□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA EMP24P32803 203 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA YJR128WP47162 119 aa0.32□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-HO13535 1793 aa0.32□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA RPL36BO14455 100 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA YAP3P38749 330 aa0.31□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA RPS29BP41058 56 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA SNF2P22082 1703 aa0.31□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA YIL163CP40448 117 aa0.31□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA SUA7P29055 345 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA ARL3Q02804 198 aa0.29□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA TVP18Q04767 167 aa0.28□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA HPA2Q06592 156 aa0.28□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA ENV10Q99382 181 aa0.28□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA SEC16P48415 2195 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
15S_rRNA15S_rRNA BRR2P32639 2163 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA MPC1P53157 130 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA YGR017WP53210 297 aa0.27□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA TAO3P40468 2376 aa0.27□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA QCR6P00127 147 aa0.27□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA YFR035CP43608 114 aa0.27□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA CSN9Q03981 162 aa0.26□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA FAS2P19097 1887 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA PHS1P40857 217 aa0.25□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA MYO1P08964 1928 aa0.24□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA ICS3P47034 131 aa0.24□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA ERV14P53173 138 aa0.24□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA OCA6Q12454 224 aa0.24□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA YGR240C-AQ3E786 66 aa0.24□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA AUA1P32450 94 aa0.24□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA GIM4P40005 111 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa0.24□□□□□ -2.37
15S_rRNA15S_rRNA RPL22AP05749 121 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.5 ms