RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPE3	YPR069C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPE3	YPR069C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPE3	YPR069C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPE3	YPR069C	AHT1	P29589	182 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPE3	YPR069C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPE3	YPR069C	AVO2	Q04749	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPE3	YPR069C	VAR1	P02381	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	ACB1	P31787	87 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	ACP1	P32463	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	MRPL4	P36517	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	MRPL50	P53724	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	TMA23	Q03525	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	ATC1	Q04005	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	FIT2	Q08906	153 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	CPT1	P17898	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	CDC50	P25656	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	YPR195C	Q06594	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	SAL1	D6W196	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	MRS1	P07266	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	ELF1	P36053	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	SIT1	P39980	628 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	DSK2	P48510	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	YPS5	P53057	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	YNR066C	P53752	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	SPO13	P23624	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	IRC22	P40006	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	YGL117W	P53133	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	YMR253C	Q04835	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	YOL085C	Q99345	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	HTB2	P02294	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	YCH1	P42937	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	CRC1	Q12289	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	SPC1	P46965	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	CAF40	P53829	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPE3	YPR069C	YLR302C	O13544	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	YBR292C	P38357	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	COA4	Q05809	96 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	ANT1	Q06497	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	TRS20	P38334	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	YHR173C	P38864	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	RRT13	P40042	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	TAD2	P47058	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	BRP1	P53194	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	ATP23	P53722	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	YDR366C	P87287	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	ORM2	Q06144	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	Q0255	P03881	472 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	ANB1	P19211	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	NNK1	P36003	928 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	SRB7	P47822	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	TOM7	P53507	60 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	RAV2	Q03956	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
SPE3	YPR069C	CUP2	P15315	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	AME1	P38313	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	KEG1	P43614	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	LCL2	Q08045	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	KRE9	P39005	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	YMR141C	P40211	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	COX16	P47081	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	YPL229W	Q99395	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	COQ3	P27680	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	PBA1	Q05778	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	HUA1	P40325	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	AIM34	Q03673	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SPE3	YPR069C	AGA1	P32323	725 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	MRPL28	P36527	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	YPT10	P38146	199 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	YNL217W	P40152	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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