RNA–Protein interactions for RNA: YHR087W

RTC3, Transcript of Protein of unknown function involved in RNA metabolism, yeast

Gene RTC3, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC3	YHR087W	YPR063C	Q12160	140 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	MRS1	P07266	363 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	DDI2	P0CH63	225 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	DDI3	P0CH64	225 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	YGL010W	P25338	174 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	YOR105W	Q08504	108 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	YHR213W	P0CI67	198 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	PIC2	P40035	300 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	YGL185C	P53100	379 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	MED7	Q08278	222 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	TIR1	P10863	254 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	QRI5	P32344	111 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	MRPL28	P36527	147 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	IMP2	P46972	177 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	HMRA1	P0CY11	126 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	SSS1	P35179	80 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	YMR166C	Q03829	368 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	RAV2	Q03956	351 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RTC3	YHR087W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	DAD2	P36162	133 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	CYT2	Q00873	224 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	YPS1	P32329	569 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	YPT10	P38146	199 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	YGR219W	P53307	113 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	YLR302C	O13544	120 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	TIM18	Q08749	192 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	TIR2	P33890	251 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	YGR149W	P48236	432 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	IRC23	Q08416	157 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	CYC3	P06182	269 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	YDL183C	P48569	320 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	CGR1	P53188	120 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	TOM7	P53507	60 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	HTB2	P02294	131 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	MIX23	P38162	196 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	YBR090C	P38253	122 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	AME1	P38313	324 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	GLE2	P40066	365 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	GIM5	Q04493	163 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RTC3	YHR087W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	ERS1	P17261	260 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	RPB11	P38902	120 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	POR2	P40478	281 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	COA6	Q3E846	104 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	MIC12	P38341	106 aa		12	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	YIL077C	P40508	320 aa		12	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	AIM24	P47127	394 aa		12	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	INO2	P26798	304 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	UBC7	Q02159	165 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	CUP2	P15315	225 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	MBB1	P39534	108 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	COX18	P53239	316 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	YML122C	Q03207	126 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	TRI1	Q05024	226 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	TMA17	Q12513	150 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	HUA1	P40325	198 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	PAM17	P36147	197 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	YNL194C	P40169	301 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	ATG33	Q06485	197 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RTC3	YHR087W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	YFR045W	P43617	309 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	DAD4	P69851	72 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	FZF1	P32805	299 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	CAB4	P53332	305 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	DAD1	Q12248	94 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	RPB9	P27999	122 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	OST3	P48439	350 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	IZH1	Q03419	316 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	SPG4	Q04438	115 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	SRL1	Q08673	210 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	CCW14	O13547	238 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RTC3	YHR087W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		11.91	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.2 ms