RNA–Protein interactions for RNA: YHL024W

RIM4, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene RIM4, Length 2,142 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM4	YHL024W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RIM4	YHL024W	KNH1	P50112	268 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RIM4	YHL024W	MRX11	Q03079	207 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RIM4	YHL024W	RRT7	Q07829	113 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RIM4	YHL024W	YPL162C	Q12042	273 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RIM4	YHL024W	PEX11	Q12462	236 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RIM4	YHL024W	SPO24	Q3E752	67 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RIM4	YHL024W	KTI11	Q3E840	82 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RIM4	YHL024W	PMD1	P32634	1753 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	TRX3	P25372	127 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	MST28	P39552	234 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YEA4	P40004	342 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	PHS1	P40857	217 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	IGO1	P53897	168 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	VPS71	Q03433	280 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	BOL1	Q3E793	110 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	ECM29	P38737	1868 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	HKR1	P41809	1802 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	SEC11	P15367	167 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YCR085W	P25650	117 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	SHE1	P38200	338 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	UMP1	P38293	148 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	VEL1	P53058	206 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YOR015W	Q12169	119 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	PCL9	Q12477	304 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	UBR2	Q07963	1872 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	KRE1	P17260	313 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	MKK1	P32490	508 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	ECM14	P38836	430 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	CUP9	P41817	306 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	EGT2	P42835	1041 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	BUD25	P85052	153 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	FCY1	Q12178	158 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	ATO3	Q12359	275 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	ENV10	Q99382	181 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YBR144C	P34215	104 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	MID2	P36027	376 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	PAM17	P36147	197 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YAR029W	P39549	74 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	TIS11	P47977	285 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	CAX4	P53223	239 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YMR321C	Q04898	105 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YPS3	Q12303	508 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YGL010W	P25338	174 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	PAU24	P38155	120 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	GPI19	Q04082	140 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YCR043C	P25361	127 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YCR050C	P25630	102 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	VHS2	P40463	436 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YNL234W	P53857	426 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YMR254C	Q04838	102 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	RAF1	Q06891	181 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	SRL1	Q08673	210 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YOR387C	Q08910	206 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YPL264C	Q08980	353 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YPL073C	P40323	161 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YML079W	Q03629	201 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	BSC1	Q12140	328 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
RIM4	YHL024W	DAD1	Q12248	94 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YPR011C	Q12251	326 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	MSB2	P32334	1306 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	TRP1	P00912	224 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	MRS3	P10566	314 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YBR292C	P38357	123 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	DSK2	P48510	373 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	MIC27	P50945	234 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	PAU12	P53343	120 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	ELP6	Q04868	273 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	MSA1	Q08471	629 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	CSR2	Q12734	1121 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YPR096C	O13587	100 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	HEM4	P06174	275 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RIM4	YHL024W	RPB7	P34087	171 aa		3.16	□□□□□ -1.9

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