RNA–Protein interactions for RNA: YGR165W

MRPS35, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS35, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS35	YGR165W	SIR2	P06700	562 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	SCM4	P32564	187 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	YGR026W	P53217	278 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	PRM15	Q03262	622 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	MAK3	Q03503	176 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	UPS1	Q05776	175 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	RTR2	Q12378	196 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	TRA1	P38811	3744 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	CCW14	O13547	238 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	HTB2	P02294	131 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	RPL39	P04650	51 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	YCR101C	P25607	182 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	SPS18	P32572	300 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	DOG2	P38773	246 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	DOG1	P38774	246 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	YJR056C	P47115	236 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	XPT1	P47165	209 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	GIM3	P53900	129 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	ABF2	Q02486	183 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	YMR252C	Q04814	134 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	ATG40	Q99325	256 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	YBL010C	P32788	280 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	UMP1	P38293	148 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	RMD6	P39975	231 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	IRC22	P40006	225 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	ARR2	Q06597	130 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	REP2	P03872	296 aa		2.59	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	ARO7	P32178	256 aa		2.59	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	APS1	P35181	156 aa		2.59	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	IKI1	P38874	309 aa		2.59	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	BMT5	P40493	336 aa		2.59	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	DOC1	P53068	250 aa		2.59	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	PDR17	P53844	350 aa		2.59	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	LPP1	Q04396	274 aa		2.59	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	HUT1	Q12520	339 aa		2.59	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
MRPS35	YGR165W	PEX4	P29340	183 aa		2.58	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	IRC18	P47056	224 aa		2.58	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	TTI2	P47168	421 aa		2.58	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	RIM9	Q04734	239 aa		2.58	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		2.58	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	PET54	P10834	293 aa		2.57	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	GCN3	P14741	305 aa		2.57	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	PHO85	P17157	305 aa		2.57	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	ECM31	P38122	312 aa		2.57	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	PAM16	P42949	149 aa		2.57	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	ATO3	Q12359	275 aa		2.57	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	DGK1	Q12382	290 aa		2.57	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	BPH1	P25356	2167 aa		2.57	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	ATG22	P25568	528 aa		2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	YKL102C	P34249	101 aa		2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	CPR5	P35176	225 aa		2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	DAN1	P47178	298 aa		2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	SOL1	P50278	321 aa		2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	HSK3	P69852	69 aa		2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	YML108W	Q03759	105 aa		2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	FIT1	Q04433	528 aa		2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	YPD1	Q07688	167 aa		2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	ATG41	Q12048	136 aa		2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	EMC6	Q12431	108 aa		2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	ODC2	Q99297	307 aa		2.56	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	PUT1	P09368	476 aa		2.55	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	OCH1	P31755	480 aa		2.55	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	HYM1	P32464	399 aa		2.55	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	FCY21	P40039	528 aa		2.55	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	SER2	P42941	309 aa		2.55	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	YGR042W	P53227	271 aa		2.55	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	DID2	P69771	204 aa		2.55	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	YLR031W	Q07978	186 aa		2.55	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	YNG1	Q08465	219 aa		2.55	□□□□□ -2
MRPS35	YGR165W	YLR156W	P0CE96	114 aa		2.54	□□□□□ -2

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