RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	PAU7	P39545	55 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	TDA4	P47153	279 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	RAV2	Q03956	351 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YDR114C	Q04597	100 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	ATG33	Q06485	197 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YDL157C	Q12082	118 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	MDM10	P18409	493 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YCR022C	P25620	114 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	UTR5	P32630	166 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	DOG2	P38773	246 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	HAC1	P41546	238 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YJL028W	P47062	111 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YGR018C	P53211	109 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	HST4	P53688	370 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YNL046W	P53956	172 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	CRZ1	P53968	678 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	GAT3	Q07928	141 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	CSM4	Q08955	156 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YBR090C	P38253	122 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YBR220C	P38318	560 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YHL037C	P38733	133 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	LST8	P41318	303 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	BNA2	P47125	453 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YGL230C	P53074	147 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YGR151C	P53287	111 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	UPS3	Q04006	179 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	API2	Q04413	109 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	RKI1	Q12189	258 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	RPL39	P04650	51 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	DDI2	P0CH63	225 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	DDI3	P0CH64	225 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	RRT1	P38192	103 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.98	□□□□□ -1.77	not detected
UBX7	YBR273C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YIP1	P53039	248 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	SDS23	P53172	527 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	CSF1	Q12150	2958 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	IRA2	P19158	3079 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	SEC11	P15367	167 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	MRP49	P32388	137 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YFL051C	P43552	160 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YFL015C	P43578	164 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YFR045W	P43617	309 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YJL163C	P46996	555 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	BRP1	P53194	125 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	TOM7	P53507	60 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YDR366C	P87287	132 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	COX17	Q12287	69 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	ADE8	P04161	214 aa		3.96	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.96	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	MIC26	P50087	233 aa		3.96	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	SED1	Q01589	338 aa		3.96	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YML079W	Q03629	201 aa		3.96	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	MIX17	Q03667	156 aa		3.96	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	DPP1	Q05521	289 aa		3.96	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	CSI2	Q08054	341 aa		3.96	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	AYT1	Q12226	474 aa		3.96	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	YOR029W	Q12243	111 aa		3.96	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	DAD1	Q12248	94 aa		3.96	□□□□□ -1.77
UBX7	YBR273C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
UBX7	YBR273C	MIG1	P27705	504 aa		3.95	□□□□□ -1.78
UBX7	YBR273C	YPS1	P32329	569 aa		3.95	□□□□□ -1.78
UBX7	YBR273C	FZF1	P32805	299 aa		3.95	□□□□□ -1.78
UBX7	YBR273C	TIR2	P33890	251 aa		3.95	□□□□□ -1.78
UBX7	YBR273C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
UBX7	YBR273C	GPI18	P38211	433 aa		3.95	□□□□□ -1.78
UBX7	YBR273C	YPI1	P43587	155 aa		3.95	□□□□□ -1.78
UBX7	YBR273C	DAD4	P69851	72 aa		3.95	□□□□□ -1.78
UBX7	YBR273C	GTO3	Q04806	366 aa		3.95	□□□□□ -1.78
UBX7	YBR273C	YDL009C	Q12210	107 aa		3.95	□□□□□ -1.78
UBX7	YBR273C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		3.95	□□□□□ -1.78
UBX7	YBR273C	IRA1	P18963	3092 aa		3.95	□□□□□ -1.78

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