RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 BNIP3LO60238 219 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 DIAPH2O60879 1101 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CNTFP26441 200 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CASP4P49662 377 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 RARRES1P49788 294 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PPIL2Q13356 520 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 BFSP2Q13515 415 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 LONRF1Q17RB8 773 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 KRT80Q6KB66 452 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 YAF2Q8IY57 180 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PTPRN2Q92932 1015 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 YY1AP1Q9H869 796 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 RRN3Q9NYV6 651 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MYPNQ86TC9 1320 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PJA2O43164 708 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PROSCO94903 275 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ZIM3Q96PE6 472 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 EGFL8Q99944 293 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 NID2Q14112 1375 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MYL2P10916 166 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ASB7Q9H672 318 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ANP32DO95626 131 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PAEPP09466 180 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 NCAM1P13591 858 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 OR1G1P47890 313 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ALDH1A3P47895 512 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GTF2H3Q13889 308 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ACCSLQ4AC99 568 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 RASIP1Q5U651 963 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CAVIN3Q969G5 261 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM4Q9C037 500 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC37A3O60309 1634 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL2O95198 593 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GUCY1A3Q02108 690 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 STX3Q13277 289 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CRY2Q49AN0 593 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 BTBD6Q96KE9 485 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 FGD4Q96M96 766 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 WDCPQ9H6R7 721 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CARNS1A5YM72 827 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 F5H423 210 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PDHXO00330 501 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TLR2O60603 784 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 STMN1P16949 149 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ST8SIA6P61647 398 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 IL1RL1Q01638 556 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ACAP1Q15027 740 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC14Q15048 493 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GRIK4Q16099 956 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CCNG2Q16589 344 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 C16orf89Q6UX73 402 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.74□□□□□ -1.33
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