RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	TFAP4	Q01664	338 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	GRIN1	Q05586	938 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	GRIK3	Q13003	919 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR158	Q5T848	1215 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ECT2	Q9H8V3	914 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	MTRR	Q9UBK8	725 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ANK2	Q01484	3957 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	HBP1	O60381	514 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ITGA2B	P08514	1039 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	CD6	P30203	668 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	GRIA4	P48058	902 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	CLCN3	P51790	818 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	PDGFRL	Q15198	375 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	SBK1	Q52WX2	424 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	TNNI3K	Q59H18	835 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF276	Q8N554	614 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	HASPIN	Q8TF76	798 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX19	Q92543	992 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	RABGGTA	Q92696	567 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	SMR3A	Q99954	134 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR174	Q9BXC1	333 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP72	Q9P209	647 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	7.04	□□□□□ -1.28	2e-7	■□□□□ 9.1
SNAP23-223	ENST00000627440	ABCA4	P78363	2273 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	OPA1	O60313	960 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAM23	O75077	832 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	C22orf31	O95567	290 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	SCNN1G	P51170	649 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	STAT5B	P51692	787 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	PER3	P56645	1201 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP4A11	Q02928	519 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	TWF1	Q12792	350 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ISX	Q2M1V0	245 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	CATSPER2	Q96P56	530 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	CD93	Q9NPY3	652 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNAP23-223	ENST00000627440	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	BCAR3	O75815	825 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKCB	P05771	671 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	HEXA	P06865	529 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	NR1D1	P20393	614 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	WEE1	P30291	646 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC5A2	P31639	672 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	MLH1	P40692	756 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	CTSK	P43235	329 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	DAB2	P98082	770 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	ROR1	Q01973	937 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	NR1H3	Q13133	447 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	LAYN	Q6UX15	382 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	NLRX1	Q86UT6	975 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	JAML	Q86YT9	394 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	SAP25	Q8TEE9	199 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNAP23-223	ENST00000627440	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		7.02	□□□□□ -1.29

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