RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 LRRC63Q05C16 580 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 HTR4Q13639 388 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 ZACNQ401N2 412 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 PARM1Q6UWI2 310 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 TAF4BQ92750 862 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 ABCB6Q9NP58 842 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 A0A1W2PRU2 124 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 STK25O00506 426 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 TRIM49P0CI25 452 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 TRIM49CP0CI26 452 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 GJA1P17302 382 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 RFX1P22670 979 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 CYP2F1P24903 491 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 ENPEPQ07075 957 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 CAMK4Q16566 473 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 FGF14Q92915 247 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 MYO10Q9HD67 2058 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 BICDL2A1A5D9 508 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 HCRTO43612 131 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 ATP2C2O75185 946 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 CFHP08603 1231 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 SRFP11831 508 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 CCNE1P24864 410 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 GABRR2P28476 465 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 CCR2P41597 374 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 EPHA5P54756 1037 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 TEAD2Q15562 447 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 GPR152Q8TDT2 470 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 KXD1Q9BQD3 176 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 VNN1O95497 513 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 HLA-DRAP01903 254 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 CSH1P0DML2 217 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 CSH2P0DML3 217 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 ATF6P18850 670 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 ANXA13P27216 316 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 CDC25CP30307 473 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 GTF2H1P32780 548 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 GRIK1P39086 918 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 CDH8P55286 799 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 DDR2Q16832 855 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 KRT39Q6A163 491 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 FAM171BQ6P995 826 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 ASIC4Q96FT7 647 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 GBP4Q96PP9 640 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.824e-8■■■■■ 174.9
GIPC1-210ENST00000589497 TSC2P49815 1807 aa20.18■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 ECI2O75521 394 aa20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 PPP3CAQ08209 521 aa20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 MORC3Q14149 939 aa20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 FBXL6Q8N531 539 aa20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 NELFBQ8WX92 580 aa20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 MYLPFQ96A32 169 aa20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 TNIP3Q96KP6 325 aa20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 WNT16Q9UBV4 365 aa20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.16■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 DPYSL4O14531 572 aa20.16■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 BDNFP23560 247 aa20.16■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 RAP1GAPP47736 663 aa20.16■□□□□ 0.82
GIPC1-210ENST00000589497 GPR15P49685 360 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms