RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 ARID3AQ99856 593 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 STK33Q9BYT3 514 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 GANQ9H2C0 597 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 FZD8Q9H461 694 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ABCB6Q9NP58 842 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 LZTS1Q9Y250 596 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 USP20Q9Y2K6 914 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 SPG11Q96JI7 2443 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 FAM86B1E9PN63 330 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 EDIL3O43854 480 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 GGPS1O95749 300 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ZNF286BP0CG31 522 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 HOXC8P31273 242 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 GTF2H1P32780 548 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 SMTNP53814 917 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 SATB1Q01826 763 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 PRKCQQ04759 706 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ARHGAP1Q07960 439 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 TKFCQ3LXA3 575 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 C4orf17Q53FE4 359 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ARSHQ5FYA8 562 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 MYCT1Q8N699 235 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.63□□□□□ -1.03
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GGA3-218ENST00000584243 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 SLC35C1Q96A29 364 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ACCSQ96QU6 501 aa8.63□□□□□ -1.03
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GGA3-218ENST00000584243 MMS19Q96T76 1030 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 RNF146Q9NTX7 359 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 GCNT4Q9P109 453 aa8.63□□□□□ -1.03
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GGA3-218ENST00000584243 PPME1Q9Y570 386 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.63□□□□□ -1.03
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GGA3-218ENST00000584243 F8P00451 2351 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 LNP1A1A4G5 178 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 B8ZZF3 427 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ENC1O14682 589 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 NDC80O14777 642 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 SASH3O75995 380 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 NOL4O94818 638 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 TMEM253P0C7T8 217 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 GHRP10912 638 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 PON1P27169 355 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ACTN2P35609 894 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 SOX5P35711 763 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 JAM2P57087 298 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 PLCB3Q01970 1234 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 CYP27A1Q02318 531 aa8.62□□□□□ -1.03
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GGA3-218ENST00000584243 ECM1Q16610 540 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 USH1GQ495M9 461 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 FAM26DQ5JW98 314 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 LRIG3Q6UXM1 1119 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 OTUD6AQ7L8S5 288 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 THNSL1Q8IYQ7 743 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 C3orf20Q8ND61 904 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 FAM76AQ8TAV0 307 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 RFFLQ8WZ73 363 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 KIFAP3Q92845 792 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 NXPE3Q969Y0 559 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 TRIM11Q96F44 468 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.62□□□□□ -1.03
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