RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATAD1Q8NBU5 361 aa35.32■■■■□ 3.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 S1PR5Q9H228 398 aa35.32■■■■□ 3.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPY26PQ9H489 355 aa35.32■■■■□ 3.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRTAC1Q9NQ79 661 aa35.32■■■■□ 3.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 CISHQ9NSE2 258 aa35.32■■■■□ 3.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYBPHLA2RUH7 354 aa35.32■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP2C2O75185 946 aa35.32■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP1A3P13637 1013 aa35.32■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD58P19256 250 aa35.32■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUSP4Q13115 394 aa35.32■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa35.32■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAM7Q9H2U9 754 aa35.32■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 DPEP3Q9H4B8 488 aa35.32■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa35.32■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CILPO75339 1184 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAPLNO95428 1278 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 COPB1P53618 953 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 GCNT1Q02742 428 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMC5Q6UXY8 1006 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 APOL5Q9BWW9 433 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC9A1P19634 815 aa35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 PON1P27169 355 aa35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF445P59923 1031 aa35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPM4P67936 248 aa35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CES5AQ6NT32 575 aa35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRISPLD1Q9H336 500 aa35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 HMGXB4Q9UGU5 601 aa35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 INSL5Q9Y5Q6 135 aa35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC142Q17RM4 750 aa35.29■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa35.29■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 C4orf50Q6ZRC1 276 aa35.29■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP35.29■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 NT5C1AQ9BXI3 368 aa35.29■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa35.29■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCB6Q9NP58 842 aa35.29■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFAP221Q4G0U5 840 aa35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP26C1Q6V0L0 522 aa35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF19Q8IW93 802 aa35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRYBG2Q8N1P7 616 aa35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCED1BQ96HM7 432 aa35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKD2Q9BZL6 878 aa35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAI2Q9GZS0 605 aa35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRG1P02750 347 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUFMP49411 452 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDR1P51861 262 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 MDH1BQ5I0G3 518 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 FKBP15Q5T1M5 1219 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR149Q86SP6 731 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACOT1Q86TX2 421 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 WHAMMQ8TF30 809 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYLPFQ96A32 169 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM81BQ96LP2 452 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 APEX2Q9UBZ4 518 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 YIPF1Q9Y548 306 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf16Q68DN1 1984 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBTPS2O43462 519 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 POU2F2P09086 479 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRAGAQ7L523 313 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC9BQ8N6N2 239 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 TWNKQ96RR1 684 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 LGALS16A8MUM7 142 aa35.26■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 MGAT5BQ3V5L5 792 aa35.26■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPRDP23468 1912 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 XYLBO75191 536 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP27A1Q02318 531 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNMA1Q12791 1236 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLD1Q13393 1074 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 ORC1Q13415 861 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBR7Q8N806 425 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUSD6Q92537 303 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 KAT5Q92993 513 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 JAKMIP2Q96AA8 810 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRXCR2A6NFK2 248 aa35.24■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC34A2O95436 690 aa35.24■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALDH1A3P47895 512 aa35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms