RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIDD1Q9HB75 910 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRG1P02750 347 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOXA9P31269 272 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 NDST1P52848 882 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 ORC1Q13415 861 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCAPHQ15003 741 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 RTL10Q7L3V2 364 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM50BQ9Y247 325 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAPLNO95428 1278 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 TWF1Q12792 350 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMARCB1Q12824 385 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 VWA3BQ502W6 1294 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 MIIPQ5JXC2 388 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 POMKQ9H5K3 350 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 YIPF1Q9Y548 306 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 VCANP13611 3396 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTHFRP42898 656 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF165P49910 485 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACOT1Q86TX2 421 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYLPFQ96A32 169 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 NT5C1BQ96P26 610 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 NDST4Q9H3R1 872 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 GCNT4Q9P109 453 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 XYLBO75191 536 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP2F1P24903 491 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP27A1Q02318 531 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 INCA1Q0VD86 236 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CUL2Q13617 745 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCED1BQ96HM7 432 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 TWNKQ96RR1 684 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPRDP23468 1912 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALDH1A3P47895 512 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT31Q15323 416 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 UNC93AQ86WB7 457 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CISHQ9NSE2 258 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP72Q9P209 647 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.33■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOTCH4Q99466 2003 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 CILPO75339 1184 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 NTHL1P78549 312 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF394Q53GI3 561 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 GBP6Q6ZN66 633 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 RRAGAQ7L523 313 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 WHAMMQ8TF30 809 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNIP3Q96KP6 325 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 VPS16Q9H269 839 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF18P17022 549 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC9A1P19634 815 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR15P49685 360 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 KAT5Q92993 513 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCB6Q9NP58 842 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMTNL1A8MU46 457 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLDN5O00501 218 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 POU2F2P09086 479 aa22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms