RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558816.5

SEMA6D-210, Transcript of semaphorin 6D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SEMA6D, Length 4,419 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6D-210ENST00000558816 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 CYB561D2O14569 222 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 VTNP04004 478 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 KRT3P12035 628 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 LCP1P13796 627 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 CLK2P49760 499 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 DYNLT1P63172 113 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 ZNF677Q86XU0 584 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 EFCAB3Q8N7B9 438 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 HSPH1Q92598 858 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 HDAC11Q96DB2 347 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 CFHR5Q9BXR6 569 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 TXLNGYQ9BZA5 131 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 DCLK3Q9C098 648 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 FAM114A2Q9NRY5 505 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 PLA2G4CQ9UP65 541 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa5.86□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 RNF40O75150 1001 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 GPC4O75487 556 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 CHEK2O96017 543 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 HLA-DRAP01903 254 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 ARP10275 920 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 MAPTP10636 758 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 ACADMP11310 421 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 NDUFV1P49821 464 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 DEUP1Q05D60 604 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 KRT31Q15323 416 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 TMED2Q15363 201 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 RAB30Q15771 203 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 ZCWPW2Q504Y3 356 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 MIIPQ5JXC2 388 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 ARMC6Q6NXE6 501 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 RAD9BQ6WBX8 426 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 SLC30A10Q6XR72 485 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 DSG4Q86SJ6 1040 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 HERC6Q8IVU3 1022 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 RMDN1Q96DB5 314 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 TSPAN18Q96SJ8 248 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 SH2D3AQ9BRG2 576 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 ACKR2O00590 384 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 SLC37A4O43826 429 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 INHAP05111 366 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 TRIM49P0CI25 452 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 TRIM49CP0CI26 452 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 MYL4P12829 197 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 SELPP16109 830 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 GUCY2CP25092 1073 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 DNAJB2P25686 324 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 GTF2H1P32780 548 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 PRCPP42785 496 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 PRAMEP78395 509 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 BEX3Q00994 111 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 CCDC142Q17RM4 750 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 FBXO47Q5MNV8 452 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 PCGF5Q86SE9 256 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 CATSPER3Q86XQ3 398 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 SLC7A14Q8TBB6 771 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 SPIRE2Q8WWL2 714 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 SH3KBP1Q96B97 665 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 NFASCO94856 1347 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 H3BQF6 201 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 CLGNO14967 610 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 AP1G2O75843 785 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 TMCC1O94876 653 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 FGF19O95750 216 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 SAT1P21673 171 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 SULT1E1P49888 294 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 MNAT1P51948 309 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 CCL23P55773 120 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 VSNL1P62760 191 aa5.85□□□□□ -1.47
SEMA6D-210ENST00000558816 SKOR1P84550 965 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms