RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SETD4	Q9NVD3	440 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	KIF3A	Q9Y496	699 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	GRIN2D	O15399	1336 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	STK36	Q9NRP7	1315 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPRS	Q13332	1948 aa		5.21	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	NID2	Q14112	1375 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	C22orf46	C9J442	243 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	ABLIM1	O14639	778 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	MSH4	O15457	936 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	TDP2	O95551	362 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	FGB	P02675	491 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	MMP1	P03956	469 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	CYBB	P04839	570 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP3A4	P08684	503 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	GNAT1	P11488	350 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	CSF2RA	P15509	400 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNA2	P16389	499 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	MCM7	P33993	719 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	THPO	P40225	353 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	BCL6	P41182	706 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	BFSP2	Q13515	415 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	SHH	Q15465	462 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	TESK1	Q15569	626 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	CEP68	Q76N32	757 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	NEK8	Q86SG6	692 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	HSCB	Q8IWL3	235 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	METTL13	Q8N6R0	699 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	KAT2B	Q92831	832 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNN1	Q92952	543 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	TOX2	Q96NM4	488 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	PIF1	Q9H611	641 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF302	Q9NR11	478 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	HTT	P42858	3142 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	SI	P14410	1827 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A087WWV3	80 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA0355	O15063	1070 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	CD4	P01730	458 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	NTRK1	P04629	796 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	DBH	P09172	617 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	INSRR	P14616	1297 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	ITGB8	P26012	769 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	NKX3-2	P78367	333 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	ST3GAL1	Q11201	340 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	PPFIA1	Q13136	1202 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	LSAMP	Q13449	338 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	NR1I3	Q14994	352 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	CALCRL	Q16602	461 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-238	ENST00000556288	MFSD5	Q6N075	450 aa		5.2	□□□□□ -1.58

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