RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 ATP2B3Q16720 1220 aa3.27□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TPH2Q8IWU9 490 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 REPS2Q8NFH8 660 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 KLHL15Q96M94 604 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 Q96MT0 163 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 LDAHQ9H6V9 325 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 HPS4Q9NQG7 708 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa3.27□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 PPEF2O14830 753 aa3.27□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 ADRA2BP18089 450 aa3.27□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 RAB5BP61020 215 aa3.27□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 C1DQ13901 141 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NR6A1Q15406 480 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CHRNA6Q15825 494 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 UGP2Q16851 508 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 C4orf50Q6ZRC1 276 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MICU3Q86XE3 530 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 KIAA0825Q8IV33 1275 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ATL2Q8NHH9 583 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM162AQ96A26 154 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 KIF25Q9UIL4 384 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF112Q9UJU3 913 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ADGRA2Q96PE1 1338 aa3.27□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF202O95125 648 aa3.27□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 TCF4P15884 667 aa3.27□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP3.27□□□□□ -1.892e-6■■■■□ 22.6
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JMJD1C-210ENST00000542921 AGAP6Q5VW22 663 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D9BQ66K14 1250 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF554Q86TJ5 538 aa3.27□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 TNS4Q8IZW8 715 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 SNX12Q9UMY4 172 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 WASF3Q9UPY6 502 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 LRRC53A6NM62 1247 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 DPYSL4O14531 572 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ATE1O95260 518 aa3.27□□□□□ -1.89
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