RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529998.5

UBASH3B-205, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 698 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-205ENST00000529998 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.28□□□□□ -0.92
UBASH3B-205ENST00000529998 MYO10Q9HD67 2058 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 MYH10P35580 1976 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 A8MXQ7 604 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 PMM2O15305 246 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 XYLBO75191 536 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 LRG1P02750 347 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 P4HA1P13674 534 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 CYP2F1P24903 491 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 TYRO3Q06418 890 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 SMARCB1Q12824 385 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 STX1AQ16623 288 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 LMO3Q8TAP4 145 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 SPPL2BQ8TCT7 592 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 ANO10Q9NW15 660 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 HMGXB4Q9UGU5 601 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 YIPF1Q9Y548 306 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 CLUHO75153 1309 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 POU2F2P09086 479 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 PTPN2P17706 415 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 ATF6P18850 670 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 CD58P19256 250 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 PTMSP20962 102 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 ALDH1A3P47895 512 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 GPR15P49685 360 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 NDST1P52848 882 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 LRMPQ12912 555 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 ORC1Q13415 861 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 WDR44Q5JSH3 913 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 ACOT1Q86TX2 421 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 GPR152Q8TDT2 470 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 WHAMMQ8TF30 809 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 MYLPFQ96A32 169 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 PCED1BQ96HM7 432 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 TWNKQ96RR1 684 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 ARID3AQ99856 593 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 CORO1BQ9BR76 489 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 OBSL1O75147 1896 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 SYCE3A1L190 88 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 KCNJ18B7U540 433 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 CLDN5O00501 218 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 P4HA2O15460 535 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 CILPO75339 1184 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 RHOP08100 348 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 BDNFP23560 247 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 FSHRP23945 695 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 CCR2P41597 374 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 EPHB3P54753 998 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 CYP27A1Q02318 531 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 INCA1Q0VD86 236 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 KCNJ12Q14500 433 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 NCAPHQ15003 741 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 DDR2Q16832 855 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC5A9Q2M3M2 681 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 CFAP221Q4G0U5 840 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 TCP11X2Q5H9J9 407 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 MIIPQ5JXC2 388 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 SDHAF4Q5VUM1 108 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 PAQR9Q6ZVX9 377 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-205ENST00000529998 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms