RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520489.5

BIN3-208, Transcript of bridging integrator 3, human

TSL 2

Gene BIN3, Length 3,589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BIN3-208	ENST00000520489	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	CFB	P00751	764 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	NAMPT	P43490	491 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	SATB1	Q01826	763 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TNIP1	Q15025	636 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	LRRC14	Q15048	493 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	P3H1	Q32P28	736 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	LIN9	Q5TKA1	542 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	CSRNP1	Q96S65	589 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	BCO2	Q9BYV7	579 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	PORCN	Q9H237	461 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	CFH	P08603	1231 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	ZPBP2	Q6X784	338 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	ISL2	Q96A47	359 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TLDC2	A0PJX2	215 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	NFIB	O00712	420 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	DIAPH2	O60879	1101 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	ATP9A	O75110	1047 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	HLA-DRA	P01903	254 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	GLRA2	P23416	452 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	L1CAM	P32004	1257 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	PEX3	P56589	373 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TBCC	Q15814	346 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	ADCY8	P40145	1251 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	NUMB	P49757	651 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	AP1B1	Q10567	949 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	GRM2	Q14416	872 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	CCDC125	Q86Z20	511 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	WDR49	Q8IV35	697 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	GSC2	O15499	205 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TOM1	O60784	492 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TOMM70	O94826	608 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	UPP2	O95045	317 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	GSR	P00390	522 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	ATP4A	P20648	1035 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	IFNAR2	P48551	515 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	CDK16	Q00536	496 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	OTOF	Q9HC10	1997 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	MARK3	P27448	753 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	CACNB3	P54284	484 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TGFB2	P61812	414 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TUBB3	Q13509	450 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	ARMC3	Q5W041	872 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	CENPU	Q71F23	418 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	PWWP2A	Q96N64	755 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	DPYSL4	O14531	572 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	CHAD	O15335	359 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	CRABP2	P29373	138 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	PCK1	P35558	622 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	ARC	Q7LC44	396 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BIN3-208	ENST00000520489	ERP27	Q96DN0	273 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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