RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CEP120	Q8N960	986 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF653	Q96CK0	615 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	TOX2	Q96NM4	488 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	DPH5	Q9H2P9	285 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	MED4	Q9NPJ6	270 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		6.19	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC188	H7C350	402 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730		K7ERI5	159 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	TP73	O15350	636 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	TREH	O43280	583 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	HOXA2	O43364	376 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	MAN1A2	O60476	641 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CD4	P01730	458 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CLTB	P09497	229 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC172	P0C7W6	258 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	GNAT1	P11488	350 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT5	P13647	590 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	TCF4	P15884	667 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	RAG1	P15918	1043 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	PROZ	P22891	400 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	RRM1	P23921	792 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CYP2C18	P33260	490 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	HSD17B3	P37058	310 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	PIK3CA	P42336	1068 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF132	P52740	706 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CCL23	P55773	120 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	PTEN	P60484	403 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	MYL6	P60660	151 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	NOMO3	P69849	1222 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	GCNT1	Q02742	428 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CUL2	Q13617	745 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	SNX17	Q15036	470 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	ALS2CL	Q60I27	953 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	PASD1	Q8IV76	773 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CXorf38	Q8TB03	319 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	TFAP2B	Q92481	460 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	BAD	Q92934	168 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	C18orf8	Q96DM3	657 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	SDCBP2	Q9H190	292 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CARD9	Q9H257	536 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	POLI	Q9UNA4	740 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	PLAA	Q9Y263	795 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	SNX24	Q9Y343	169 aa		6.18	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		6.17	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	MYO1F	O00160	1098 aa		6.17	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	FSCN2	O14926	492 aa		6.17	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	HBP1	O60381	514 aa		6.17	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	6.17	□□□□□ -1.42
C4BPB-208	ENST00000492730	PHF2	O75151	1096 aa		6.17	□□□□□ -1.42

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