RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491642.5

SUCLG1-209, Transcript of succinate-CoA ligase alpha subunit, human

TSL 3

Gene SUCLG1, Length 717 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLG1-209	ENST00000491642	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	LY9	Q9HBG7	655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	SVIL	O95425	2214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	KNTC1	P50748	2209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	MEI4	A8MW99	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	ENC1	O14682	589 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	PTGES	O14684	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	ABLIM3	O94929	683 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	UBE4B	O95155	1302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	KRT7	P08729	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	OPRD1	P41143	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	USP46	P62068	366 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	KDSR	Q06136	332 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	CLN3	Q13286	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	TGIF1	Q15583	401 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	GJA10	Q969M2	543 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	USP20	Q9Y2K6	914 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUCLG1-209	ENST00000491642	TACC2	O95359	2948 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	ATR	Q13535	2644 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	NFASC	O94856	1347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	B4GALT5	O43286	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	USP12	O75317	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	RECQL4	O94761	1208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	NPTXR	O95502	500 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	CER1	O95813	267 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	ATF2	P15336	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	TMOD1	P28289	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	GABRR2	P28476	465 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	TNFSF9	P41273	254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	GRK6	P43250	576 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	SLC26A2	P50443	739 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	PRKCE	Q02156	737 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	GAB4	Q2WGN9	574 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	CACUL1	Q86Y37	369 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUCLG1-209	ENST00000491642	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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