RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 KLRC2P26717 231 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 MAGEA4P43358 317 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CDC42EP1Q00587 391 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 RIPK1Q13546 671 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CAPSQ13938 189 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 FAM187BQ17R55 369 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 AADACL2Q6P093 401 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 RGS9BPQ6ZS82 235 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CENPUQ71F23 418 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PACS2Q86VP3 889 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 VSIG1Q86XK7 387 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CCDC13Q8IYE1 715 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ALLCQ8N6M5 410 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 APBB2Q92870 758 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TMEM143Q96AN5 459 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB9Q96C00 473 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 BTBD6Q96KE9 485 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 MAGEB18Q96M61 343 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 C11orf70Q9BRQ4 267 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 FZD8Q9H461 694 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 MROH8Q9H579 483 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ASB7Q9H672 318 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PCDH9Q9HC56 1237 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CHST7Q9NS84 486 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 KLC4Q9NSK0 619 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ZNF148Q9UQR1 794 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ASB14A6NK59 587 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.975e-9■■■■□ 20.1
ACTB-208ENST00000464611 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SNX3O60493 162 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SPAG6O75602 509 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 RASSF9O75901 435 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 RNF8O76064 485 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PRKCBP05771 671 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 MCF2P10911 925 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 FGFR4P22455 802 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PROZP22891 400 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SSR1P43307 286 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SP2Q02086 613 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SNX1Q13596 522 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ACVR2BQ13705 512 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 KYNUQ16719 465 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SEPT14Q6ZU15 432 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 AFG1LQ8WV93 481 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SLITRK1Q96PX8 696 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.978e-10■■□□□ 12.1
ACTB-208ENST00000464611 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TRIM7Q9C029 511 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ACP6Q9NPH0 428 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 AAASQ9NRG9 546 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CISHQ9NSE2 258 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa8.97□□□□□ -0.97
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