RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460509.1

VBP1-202, Transcript of VHL binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene VBP1, Length 586 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1-202ENST00000460509 VAV2P52735 878 aa5.76□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 ZNF134P52741 427 aa5.76□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 BIRC2Q13490 618 aa5.76□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 TUBB3Q13509 450 aa5.76□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 DAG1Q14118 895 aa5.76□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 PLA1AQ53H76 456 aa5.76□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 ARMC6Q6NXE6 501 aa5.76□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 ZDHHC24Q6UX98 284 aa5.76□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 UNC13DQ70J99 1090 aa5.76□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 MICU3Q86XE3 530 aa5.76□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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VBP1-202ENST00000460509 CASS4Q9NQ75 786 aa5.76□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 INTS13Q9NVM9 706 aa5.76□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 GPRC5BQ9NZH0 403 aa5.76□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.76□□□□□ -1.49
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VBP1-202ENST00000460509 E7ENX8 843 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 hCG_1984214I3L0E3 225 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 TRIAP1O43715 76 aa5.75□□□□□ -1.49
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VBP1-202ENST00000460509 SOAT2O75908 522 aa5.75□□□□□ -1.49
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VBP1-202ENST00000460509 TNFSF4P23510 183 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 GATA3P23771 443 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 CASP5P51878 434 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 TAP2Q03519 686 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 TCF15Q12870 199 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 PTPAQ15257 358 aa5.75□□□□□ -1.49
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VBP1-202ENST00000460509 FAM209BQ5JX69 171 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 MIIPQ5JXC2 388 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 MICALCLQ6ZW33 695 aa5.75□□□□□ -1.49
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VBP1-202ENST00000460509 SNX22Q96L94 193 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa5.75□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 MARCH11A6NNE9 402 aa5.74□□□□□ -1.49
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VBP1-202ENST00000460509 FNIP2Q9P278 1114 aa5.74□□□□□ -1.49
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VBP1-202ENST00000460509 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.74□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 RASA4BC9J798 803 aa5.73□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 H7C4K7 107 aa5.73□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 RASA4O43374 803 aa5.73□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 MT-ND5P03915 603 aa5.73□□□□□ -1.49
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VBP1-202ENST00000460509 PRKAG1P54619 331 aa5.73□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 WNT3P56703 355 aa5.73□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 SLC29A2Q14542 456 aa5.73□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 VPS53Q5VIR6 699 aa5.73□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
VBP1-202ENST00000460509 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa5.73□□□□□ -1.49
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