RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	WHAMM	Q8TF30	809 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPAG5	Q96R06	1193 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	TWNK	Q96RR1	684 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYO7A	Q13402	2215 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	EPCAM	P16422	314 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	RFX1	P22670	979 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAD23B	P54727	409 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	MED10	Q9BTT4	135 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	GAN	Q9H2C0	597 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRRG1	O14668	218 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABLIM3	O94929	683 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATF2	P15336	505 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD19	P15391	556 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	DUSP4	Q13115	394 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	TPGS2	Q68CL5	300 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM171B	Q6P995	826 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBR7	Q8N806	425 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCED1B	Q96HM7	432 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	STK33	Q9BYT3	514 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	FSD2	A1L4K1	749 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTMR11	A4FU01	709 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLDN5	O00501	218 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	LINC01565	O15544	149 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP26A1	O43174	497 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CALCA	P01258	141 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PBX1	P40424	430 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMARCB1	Q12824	385 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	LILRA6	Q6PI73	481 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SHC3	Q92529	594 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYLPF	Q96A32	169 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	NUP58	Q9BVL2	599 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLDND1	Q9NY35	253 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEP72	Q9P209	647 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	DPP7	Q9UHL4	492 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	EYS	Q5T1H1	3165 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEC24A	O95486	1093 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC130	P13994	396 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	BDNF	P23560	247 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP2F1	P24903	491 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADORA2B	P29275	332 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SGO2	Q562F6	1265 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	LIN9	Q5TKA1	542 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	EFHB	Q8N7U6	833 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PKMYT1	Q99640	499 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	14.56	□□□□□ -0.08	2e-6	■■□□□ 13.1
SELENBP1-208	ENST00000447402		F8VZ95	297 aa		14.55	□□□□□ -0.08

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