RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429751.6

RRN3-203, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,198 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-203ENST00000429751 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 CHKBQ9Y259 395 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 DPPA5A6NC42 116 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 WDR64B1ANS9 1081 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 RASA4BC9J798 803 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 RASA4O43374 803 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 SLITRK3O94933 977 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ATG7O95352 703 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ASMTLO95671 621 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 PSAPP07602 524 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 NEFHP12036 1026 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ALDH3A1P30838 453 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 RASSF2P50749 326 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 DLG4P78352 724 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 TRIM32Q13049 653 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 NR1H3Q13133 447 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ODR4Q5SWX8 454 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 AP1ARQ63HQ0 302 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 RGS9BPQ6ZS82 235 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 TPH2Q8IWU9 490 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 RDH13Q8NBN7 331 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 BBOF1Q8ND07 529 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 SLC17A8Q8NDX2 589 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 DYDC2Q96IM9 177 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 SPATA33Q96N06 139 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 NUDCD1Q96RS6 583 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 STRA6Q9BX79 667 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 CHST7Q9NS84 486 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 KCND2Q9NZV8 630 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 LRRD1A4D1F6 860 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 KBTBD13C9JR72 458 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ADAMTS4O75173 837 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ARIH2O95376 493 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 NPTXRO95502 500 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ABHD2P08910 425 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ACADSP16219 412 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 GM2AP17900 193 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 PCK1P35558 622 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ADCY8P40145 1251 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 GJA8P48165 433 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 VAMP7P51809 220 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 SLC18A1P54219 525 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 FMO1Q01740 532 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 PPP3CAQ08209 521 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ADCY1Q08828 1119 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 LY6KQ17RY6 165 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 LHX8Q68G74 356 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 LONP2Q86WA8 852 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 SYCP3Q8IZU3 236 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ATL2Q8NHH9 583 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 CFAP61Q8NHU2 1237 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 MAML1Q92585 1016 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 DCLK3Q9C098 648 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 USP20Q9Y2K6 914 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 PPME1Q9Y570 386 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 KLHL33A6NCF5 533 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 ATP9AO75110 1047 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 LGR5O75473 907 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 T-ENOLP0DO92 83 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 SP2Q02086 613 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 CENPCQ03188 943 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 DNAJC3Q13217 504 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 BIRC2Q13490 618 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 SPARCL1Q14515 664 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RRN3-203ENST00000429751 TMED2Q15363 201 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms