RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396667.7

TMEM106B-201, Transcript of transmembrane protein 106B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM106B, Length 12,539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106B-201ENST00000396667 NUDT14O95848 222 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ADH1CP00326 375 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 IFNA16P05015 189 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 INHBAP08476 426 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 CDH6P55285 790 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TAF11Q15544 211 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 MICALCLQ6ZW33 695 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 RNF31Q96EP0 1072 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 FAM81BQ96LP2 452 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 SPZ1Q9BXG8 430 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 RHPN2P1A8MT19 583 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 CFAP99D6REC4 459 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 GNGT2O14610 69 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 STX1BP61266 288 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 XRCC4Q13426 336 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 SETDB1Q15047 1291 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 SH2D4BQ5SQS7 431 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 CYP8B1Q9UNU6 501 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 PBRM1Q86U86 1689 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 NRXN1Q9ULB1 1477 aa4.65□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TTC36A6NLP5 189 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 HTR1BP28222 390 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 TMEM164Q5U3C3 297 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 CD274Q9NZQ7 290 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 GRXCR1A8MXD5 290 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 TXNDC9O14530 226 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 GTF2H1P32780 548 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 PSMD8P48556 350 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 TTC39CQ8N584 583 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 GIMAP4Q9NUV9 329 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 VTI1BQ9UEU0 232 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 JMJD7P0C870 316 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 ZNF853P0CG23 659 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 SMPD1P17405 629 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 EPHB2P29323 1055 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 GUCY1A2P33402 732 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 GRIK5Q16478 980 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 ANO7Q6IWH7 933 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 UNC45BQ8IWX7 931 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 TTPALQ9BTX7 342 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 DCLK3Q9C098 648 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 IMPACTQ9P2X3 320 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 EXTL3O43909 919 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 ATG13O75143 517 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 IFNA8P32881 189 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 KCNJ5P48544 419 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 STILQ15468 1287 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 MMEL1Q495T6 779 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 NLNQ9BYT8 704 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 GRXCR2A6NFK2 248 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 INPP4BO15327 924 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 KCNA2P16389 499 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 SLC26A2P50443 739 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 FAM129CQ86XR2 697 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 CLYBLQ8N0X4 340 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 IPMKQ8NFU5 416 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 NPLOC4Q8TAT6 608 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 FAR2Q96K12 515 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 IL12RB2Q99665 862 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 MAD2L2Q9UI95 211 aa4.65□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 TRIM66O15016 1216 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 CALB1P05937 261 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 IVLP07476 585 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 CDC25CP30307 473 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 TRIM32Q13049 653 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 LCA5Q86VQ0 697 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 RASGRP3Q8IV61 690 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 KREMEN2Q8NCW0 462 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 HERVK_113Q902F9 699 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 LY9Q9HBG7 655 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 ZNF212Q9UDV6 495 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 ARHGAP42A6NI28 874 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 DLL1O00548 723 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 SERPINI2O75830 405 aa4.64□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 MYO1DO94832 1006 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms