RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 WNT3P56703 355 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM108Q6UXF1 575 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 VRK3Q8IV63 474 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC146Q8IYE0 955 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 MPP5Q8N3R9 675 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 LNX2Q8N448 690 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 MSLNLQ96KJ4 702 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 Q96MF0 132 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 MESP1Q9BRJ9 268 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0B4J269 797 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 RHPN2P1A8MT19 583 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIAP1O43715 76 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 FSHBP01225 129 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 SRGNP10124 158 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 ACVRL1P37023 503 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 LILRA4P59901 499 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBB3Q13509 450 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC44A4Q53GD3 710 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 IL31Q6EBC2 164 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 LAYNQ6UX15 382 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZPA2 131 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF627Q7L945 461 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 LCORLQ8N3X6 602 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.653e-9■■■■■ 50.3
RABGGTB-202ENST00000370826 OR56A3Q8NH54 315 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 SSH3Q8TE77 659 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
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RABGGTB-202ENST00000370826 CASS4Q9NQ75 786 aa4.76□□□□□ -1.65
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RABGGTB-202ENST00000370826 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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RABGGTB-202ENST00000370826 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.75□□□□□ -1.65
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RABGGTB-202ENST00000370826 CHST12Q9NRB3 414 aa4.75□□□□□ -1.65
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RABGGTB-202ENST00000370826 OVOL3O00110 214 aa4.74□□□□□ -1.65
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RABGGTB-202ENST00000370826 NEK3P51956 506 aa4.74□□□□□ -1.65
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RABGGTB-202ENST00000370826 PICALMQ13492 652 aa4.74□□□□□ -1.65
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RABGGTB-202ENST00000370826 Q6YL49 198 aa4.74□□□□□ -1.65
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RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.74□□□□□ -1.65
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RABGGTB-202ENST00000370826 COQ10AQ96MF6 247 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 STK31Q9BXU1 1019 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 TPSD1Q9BZJ3 242 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-202ENST00000370826 CHST8Q9H2A9 424 aa4.74□□□□□ -1.65
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