RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 TBX20Q9UMR3 447 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 THADAQ6YHU6 1953 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 MYMKA6NI61 221 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TK2O00142 265 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CKMP06732 381 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CLTAP09496 248 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4Q2P0C623 313 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 GNSP15586 552 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SCP2P22307 547 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX3P56589 373 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC39A12Q504Y0 691 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 MON1AQ86VX9 555 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CD302Q8IX05 232 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ENGASEQ8NFI3 743 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CHFRQ96EP1 664 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 AIFM3Q96NN9 605 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM206Q9H813 350 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 EHD2Q9NZN4 543 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 INVSQ9Y283 1065 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 USP20Q9Y2K6 914 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CITO14578 2027 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 IGF2RP11717 2491 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087WWV3 80 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP33O14559 1287 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPN9O14815 690 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 MED24O75448 989 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 LARGE1O95461 756 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINF2P08697 491 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ARSAP15289 507 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PROZP22891 400 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 P2RY2P41231 377 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 NPTX2P47972 431 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPY1Q01534 308 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNB1Q14721 858 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf27AQ580R0 203 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ZPBP2Q6X784 338 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC16Q8NEE8 873 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 USP33Q8TEY7 942 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 BICD1Q96G01 975 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SENP8Q96LD8 212 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 MTMR9Q96QG7 549 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 DNM3Q9UQ16 869 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 EML5Q05BV3 1969 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIP11Q15643 1979 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PQD8 194 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF217O75362 1048 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 APODP05090 189 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 EDN1P05305 212 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52Z1P0C646 297 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PFKLP17858 780 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 BCKDHBP21953 392 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXC13P31276 330 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCD1P33897 745 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 MCM7P33993 719 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 NLRP12P59046 1061 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 NR5A1Q13285 461 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD1Q15327 319 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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