RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 DCLK2Q8N568 766 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ROBO3Q96MS0 1386 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 MYH11P35749 1972 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 GSC2O15499 205 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 APRTP07741 180 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 PPP4R1Q8TF05 950 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 USP6NLQ92738 828 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ANLNQ9NQW6 1124 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 SMYD2Q9NRG4 433 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 PARVAQ9NVD7 372 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CLIC5Q9NZA1 410 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 IP6K2Q9UHH9 426 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 DNAJC6O75061 913 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 WEE2P0C1S8 567 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 AMPD1P23109 780 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 COA1Q9GZY4 146 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 RAB6BQ9NRW1 208 aa16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 A0A1B0GVG6 124 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CYP1A2P05177 515 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 NMUR2Q9GZQ4 415 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 GABBR1Q9UBS5 961 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 FRMPD4Q14CM0 1322 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 SNHG28P0DPA3 235 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 RBP3P10745 1247 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 NRLP54845 237 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 GAD2Q05329 585 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 USP4Q13107 963 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ATG16L1Q676U5 607 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 RINLQ6ZS11 566 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 GPD1LQ8N335 351 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 EMC1Q8N766 993 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 FEZF2Q8TBJ5 459 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 SHC3Q92529 594 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 NYAP2Q9P242 653 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CCNB1P14635 433 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 NEK3P51956 506 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ALCAMQ13740 583 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 MOXD1Q6UVY6 613 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 EEPD1Q7L9B9 569 aa16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CCDC78A2IDD5 438 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 GTF2H1P32780 548 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 FAAP100Q0VG06 881 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ASRGL1Q7L266 308 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CERS5Q8N5B7 392 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 LENG9Q96B70 501 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 MSTO1Q9BUK6 570 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 TBX20Q9UMR3 447 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 RGL2O15211 777 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 GRAP2O75791 330 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CYP3A7P24462 503 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 RARRES1P49788 294 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 IL31Q6EBC2 164 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 NDUFAF2Q8N183 169 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 WWP1Q9H0M0 922 aa16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 PYGLP06737 847 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 CYP3A4P08684 503 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 SOX11P35716 441 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 PSMC5P62195 406 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 MCL1Q07820 350 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 GALNT4Q8N4A0 578 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 E2F7Q96AV8 911 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 PDP2Q9P2J9 529 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 FESP07332 822 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ELK3P41970 407 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 NPTX2P47972 431 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 SLC25A3Q00325 362 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 CYTH1Q15438 398 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 SWSAP1Q6NVH7 229 aa16.02■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 SPATA18Q8TC71 538 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms