RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 TLR2O60603 784 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SPDYAQ5MJ70 313 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 NEDD1Q8NHV4 660 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 KCND2Q9NZV8 630 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TMEM191CA6NGB0 347 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 RPS6KA5O75582 802 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TPI1P60174 286 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 EPC2Q52LR7 807 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 C12orf60Q5U649 245 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 BBS2Q9BXC9 721 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TMEM8AQ9HCN3 771 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ZNF212Q9UDV6 495 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 USP1O94782 785 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 EPHB2P29323 1055 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ACOT2P49753 483 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PTENP60484 403 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SLC25A41Q8N5S1 370 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CCDC78A2IDD5 438 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 POLBP06746 335 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ADARP55265 1226 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TPST1O60507 370 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ASNSP08243 561 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 MICU2Q8IYU8 434 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 EPAS1Q99814 870 aa10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PDGFRAP16234 1089 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 FEZF2Q8TBJ5 459 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PODNQ7Z5L7 613 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 NEUROG2Q9H2A3 272 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 RAD17O75943 681 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 MYO1DO94832 1006 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 EFHC1Q5JVL4 640 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 KLHL23Q8NBE8 558 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PI4K2AQ9BTU6 479 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TIPINQ9BVW5 301 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 NDFIP2Q9NV92 336 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 AP3B1O00203 1094 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CRKP46108 304 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ARPP19P56211 112 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TNIP2Q8NFZ5 429 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 GDPD5Q8WTR4 605 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 MYLK2Q9H1R3 596 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SCN3BQ9NY72 215 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SNX13Q9Y5W8 968 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SIK2Q9H0K1 926 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SLC34A1Q06495 639 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SNX30Q5VWJ9 437 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CYLDQ9NQC7 956 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 FKBP6O75344 327 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SH2D3AQ9BRG2 576 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SLC39A10Q9ULF5 831 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TM9SF1O15321 606 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 NFKBIAP25963 317 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 HMOX2P30519 316 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TTMPQ5BVD1 217 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 PPP2R3CQ969Q6 453 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ZNF556Q9HAH1 456 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 NPEPPSP55786 919 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CYP4A22Q5TCH4 519 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 AP5M1Q9H0R1 490 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 C2orf40Q9H1Z8 148 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TMEM245Q9H330 911 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 WDR35Q9P2L0 1181 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ADGRA2Q96PE1 1338 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ANO4Q32M45 955 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 FIGNQ5HY92 759 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 GLMNQ92990 594 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 TMEM79Q9BSE2 394 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ADGRB2O60241 1585 aa10.6□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 CLEC4GQ6UXB4 293 aa10.59□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 AGBL1Q96MI9 1066 aa10.59□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 SEMA4AQ9H3S1 761 aa10.59□□□□□ -0.71
TTL-201ENST00000233336 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms