RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slitrk4Q810B8 837 aa5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfyve1Q810J8 777 aa5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tyw1Q8BJM7 721 aa5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Taf15Q8BQ46 557 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lrrc41Q8K1C9 807 aa5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nol6Q8R5K4 1152 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NonoQ99K48 473 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Med24Q99K74 987 aa5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ranbp17Q99NF8 1088 aa5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nup210lQ9D2F7 1881 aa5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AllcQ9JHX6 414 aa5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Capn15Q9JLG8 1095 aa5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DmtnQ9WV69 405 aa5.95□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tcp10bE9PYJ0 438 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tcp10cE9Q046 482 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm21293E9Q4G9 266 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm11237F2Z3W5 360 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm11238F2Z478 360 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem132bF7BAB2 1078 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GclmO09172 274 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnaseh1O70338 285 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ctnnal1O88327 731 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 EgfP01132 1217 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp1P08042 402 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mcpt2P15119 244 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hoxd12P23812 268 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PklrP53657 574 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AdprhP54923 362 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ntsr2P70310 416 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Casp7P97864 303 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CkbQ04447 381 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Traf3ip1Q149C2 625 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arhgef16Q3U5C8 713 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mpzl3Q3V3F6 237 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp791Q497V9 528 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Phactr4Q501J7 694 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PRAG1Q571I4 1179 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hsf5Q5ND04 624 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AktipQ64362 292 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 March6Q6ZQ89 909 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr527Q7TRT9 305 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Reps2Q80XA6 521 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Megf9Q8BH27 600 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nipa1Q8BHK1 323 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CptpQ8BS40 216 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc41a2Q8BYR8 573 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RadxQ8C779 850 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mettl24Q8CCB5 363 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scara5Q8K299 491 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sirt5Q8K2C6 310 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atat1Q8K341 421 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q922C1 641 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Polr3eQ9CZT4 710 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q9D1F3 157 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Saal1Q9D2C2 474 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc22a17Q9D9E0 401 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Doc2gQ9ESN1 387 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ApipQ9WVQ5 241 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AtrxQ61687 2476 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpr179E9PY61 2293 aa5.94□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arhgef37A1IGU4 676 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PotegA5H0M4 473 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem215A7E1Z1 235 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm3618D3Z4P5 127 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn2r17E9PYF5 849 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Usp35M0QWN7 1009 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MafgO54790 162 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SlkO54988 1233 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LifP09056 203 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PrkceP16054 737 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmod1P49813 359 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Csrp2P97314 193 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab33aP97950 237 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fgfr4Q03142 799 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NfkbidQ2TB02 327 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tubal3Q3UX10 446 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmtc2Q56A06 836 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MycbpapQ5SUV2 932 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ksr1Q61097 873 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Has1Q61647 583 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LbpQ61805 481 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adh7Q64437 374 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rps9Q6ZWN5 194 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ldoc1Q7TPY9 151 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atp6v0d2Q80SY3 350 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bank1Q80VH0 783 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q8BP99 230 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.1 ms