RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptger3P30557 365 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gmeb2P58929 530 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss48Q14B25 312 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defb28Q3V2L0 89 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MlipQ5FW52 269 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep135Q6P5D4 1140 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CcinQ8CDE2 588 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxl13Q8CDU4 790 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MrgpreQ91ZB7 310 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Add1Q9QYC0 735 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tex21Q9R0U9 575 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bpifb4A2BGH0 617 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 9230113P08RikD3YWX3 137 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm281D3Z1Y0 860 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stk10O55098 966 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wipf3P0C7L0 485 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gja1P23242 382 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Evx2P49749 475 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Flt3lgP49772 232 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc12a1P55014 1095 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wnk2Q3UH66 2149 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gas2l3Q3UWW6 683 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Foxn3Q499D0 457 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp658Q5PPQ4 887 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pla2g4cQ64GA5 597 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fnip1Q68FD7 1165 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 C1qtnf6Q6IR41 264 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttyh3Q6P5F7 524 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Jade2Q6ZQF7 829 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sox11Q7M6Y2 395 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sdccag8Q80UF4 717 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc6a17Q8BJI1 727 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rec8Q8C5S7 591 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myt1Q8CFC2 1127 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifi205aQ8CGE8 404 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adgre4Q91ZE5 689 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fads1Q920L1 447 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CactinQ9CS00 772 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gtf2ird1Q9JI57 1104 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bex2Q9WTZ8 129 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pld1Q9Z280 1074 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cacna1eQ61290 2272 aa11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prdm12A2AJ77 365 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm4302E9PX25 294 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Opn1mwO35599 359 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 C4bpaP08607 469 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RhoP15409 348 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnnc2P20801 160 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abcb4P21440 1276 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SsbP32067 415 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpinc1P32261 465 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab23P35288 237 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav8d-2Q5R1B6 112 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc20a1Q61609 681 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Oca2Q62052 833 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fkbp3Q62446 224 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RetsatQ64FW2 609 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Txndc16Q7TN22 820 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vtcn1Q7TSP5 283 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vat1lQ80TB8 417 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr35Q8BND3 1181 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bend7Q8BSV3 434 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8C4P0 716 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zc2hc1cQ8CCG1 527 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem198bQ8CFU0 350 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cog3Q8CI04 820 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mill2Q8HWE5 355 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D8Ertd738eQ8R1F0 94 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psmd2Q8VDM4 908 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psmd6Q99JI4 389 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Galnt15Q9D2N8 638 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sdr42e1Q9D665 394 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gdap2Q9DBL2 498 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scnn1gQ9WU39 655 aa11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atg2bQ80XK6 2075 aa11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cacna1bO55017 2327 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lcmt1A0A0U1RNF2 332 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptpn3A2ALK8 913 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ism1A2ATD1 454 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 9330159F19RikD3Z623 648 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm1661E9Q963 441 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4933406M09RikG3XA12 479 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfrsf11aO35305 625 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PpardP35396 440 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mcm5P49718 733 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dsc3P55850 896 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssrp1Q08943 708 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acot10Q32MW3 439 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ric8aQ3TIR3 530 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr93Q402B2 695 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hepacam2Q4VAH7 463 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gucy2gQ6TL19 1100 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tha1Q6XPS7 400 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep120Q7TSG1 988 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spata20Q80YT5 790 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 71.8 ms