RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C ECM25P32525 599 aa5.11□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YKE4P40544 346 aa5.11□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YJR015WP47090 510 aa5.11□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YGR025WP53216 100 aa5.11□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data5.11□□□□□ -1.59not detected
SPE3YPR069C GPI15P53961 229 aa5.11□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C HAL1Q01766 294 aa5.11□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C UBC7Q02159 165 aa5.11□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C MRPS16Q02608 121 aa5.11□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C ISN1Q99312 450 aa5.11□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YBR242WP38331 238 aa5.1□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C SNX4P47057 423 aa5.1□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C AIM24P47127 394 aa5.1□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C BOR1P53838 576 aa5.1□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C AYT1Q12226 474 aa5.1□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C POM34Q12445 299 aa5.1□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C SFT2P38166 215 aa5.09□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YER135CP40082 130 aa5.09□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C SGF11Q03067 99 aa5.09□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YMR082CQ04276 118 aa5.09□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C LOA1Q06508 300 aa5.09□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YOL160WQ08321 113 aa5.09□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YHR213W-AQ8TGT4 77 aa5.09□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YMR316C-AI2HB70 103 aa5.08□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C MIG3P39943 394 aa5.08□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C YEA6P39953 335 aa5.08□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C YGR269WP40326 108 aa5.08□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C SWM2P40342 146 aa5.08□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C SAS2P40963 338 aa5.08□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C MIC27P50945 234 aa5.08□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C TIM44Q01852 431 aa5.08□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C IZH1Q03419 316 aa5.08□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C YDR157WA0A023PZE8 133 aa5.07□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C PHD1P36093 366 aa5.07□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C RPR2P40571 144 aa5.07□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C ATG27P46989 271 aa5.07□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C MCM22P47167 239 aa5.07□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C ODC1Q03028 310 aa5.07□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C ERP1Q05359 219 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C RRT7Q07829 113 aa5.07□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C PRR2Q12310 699 aa5.07□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data5.06□□□□□ -1.6not detected
SPE3YPR069C YCR025CP25352 136 aa5.06□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C PPQ1P32945 549 aa5.06□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C SHB17P36136 271 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C PKP2P53170 491 aa5.06□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C ISU1Q03020 165 aa5.06□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C SHH3Q04487 196 aa5.06□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C CCW12Q12127 133 aa5.06□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C SCM3Q12334 223 aa5.06□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C DDI2P0CH63 225 aa5.05□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C DDI3P0CH64 225 aa5.05□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C PET100P38958 111 aa5.05□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C YIL077CP40508 320 aa5.05□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C YNR071CP53757 342 aa5.05□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C YLR146W-AQ2V2P1 62 aa5.05□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C YCR001WP25347 104 aa5.04□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C TIP1P27654 210 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C AFR1P33304 620 aa5.04□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C TIR2P33890 251 aa5.04□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C LSM2P38203 95 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C GAT4P40569 121 aa5.04□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C GNP1P48813 663 aa5.04□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C FMP41P53889 259 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C PTC7P38797 343 aa5.03□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C PRE5P40302 234 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C ARR3Q06598 404 aa5.03□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C YPR145C-AQ2V2P0 78 aa5.03□□□□□ -1.6
SPE3YPR069C VMA16P23968 213 aa5.02□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C YHR022CP38763 256 aa5.02□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C PNC1P53184 216 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C NPL6P32832 435 aa5.01□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C YBL059WP34224 193 aa5.01□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C VHS2P40463 436 aa5.01□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C YJR096WP47137 282 aa5.01□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C DID2P69771 204 aa5.01□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C CTR3Q06686 241 aa5.01□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C BER1Q06688 274 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C ERV2Q12284 196 aa5.01□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C TMA17Q12513 150 aa5.01□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C EMP24P32803 203 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C YEA4P40004 342 aa5□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C YDL242WQ07746 117 aa5□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C QCR9P22289 66 aa4.99□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C DER1P38307 211 aa4.99□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C PEX7P39108 375 aa4.99□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C MBB1P39534 108 aa4.99□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C MRX11Q03079 207 aa4.99□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C SNO1Q03144 224 aa4.99□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C ATX2Q12067 313 aa4.99□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C YCR075W-AQ3E830 75 aa4.99□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C YBR126W-AQ8TGU7 68 aa4.99□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C GCN3P14741 305 aa4.98□□□□□ -1.61
SPE3YPR069C SPI1P40092 148 aa4.98□□□□□ -1.61
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