RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	YPS3	Q12303	508 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	VMA16	P23968	213 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	YIP1	P53039	248 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	DYN2	Q02647	92 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	MED7	Q08278	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	YCL042W	P25572	119 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	COX15	P40086	486 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	YGR269W	P40326	108 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	DFG10	P40526	253 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	MGA1	P53050	456 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	ADE8	P04161	214 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	PHO85	P17157	305 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	YGL010W	P25338	174 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	PHD1	P36093	366 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	PHS1	P40857	217 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	YGR149W	P48236	432 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	DAD3	P69850	94 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AMD1	YML035C	NUM1	Q00402	2748 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	MRS3	P10566	314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	DAD2	P36162	133 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	MRPS9	P38120	278 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YIL163C	P40448	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	CYT2	Q00873	224 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	LDS2	Q08218	356 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	POM34	Q12445	299 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YBR184W	P38299	523 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	DER1	P38307	211 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	HUA1	P40325	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YFL054C	P43549	646 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	LST7	P53237	242 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YHP1	Q04116	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	ATO3	Q12359	275 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YJL163C	P46996	555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YJR015W	P47090	510 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	TMA17	Q12513	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	BPH1	P25356	2167 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	RPB9	P27999	122 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YBL059W	P34224	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YBR090C	P38253	122 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	TRS20	P38334	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YNL234W	P53857	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YLR118C	Q12354	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	FPR2	P32472	135 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	PRE3	P38624	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	PIC2	P40035	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	PAU5	P43575	122 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	ATG27	P46989	271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	DSK2	P48510	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YGR151C	P53287	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YJL213W	P40896	331 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	RKI1	Q12189	258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YKR045C	P36138	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	LST8	P41318	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	STP4	Q07351	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	JID1	Q12350	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YLR302C	O13544	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
AMD1	YML035C	QCR9	P22289	66 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	ELF1	P36053	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	PAM17	P36147	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	AGE2	P40529	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	OST3	P48439	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	LOA1	Q06508	300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	POS5	Q06892	414 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	MCH1	Q07376	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	FCY1	Q12178	158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	FYV7	Q12247	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	DAL3	P32459	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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