RNA–Protein interactions for RNA: YLL058W

YLL058W, Transcript of Putative protein of unknown function with similarity to Str2p, yeast

Gene YLL058W, Length 1,728 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL058W	YLL058W	NRG1	Q03125	231 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YDR114C	Q04597	100 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YMR320W	Q04897	101 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	CSI2	Q08054	341 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	RAX2	Q12465	1220 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	CHO1	P08456	276 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YML003W	P0CF16	290 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	MRPL36	P36531	177 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	TRS20	P38334	175 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	MID1	P41821	548 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	WTM2	Q12206	467 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	RPL43B	P0CX26	92 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	PMU1	P36069	295 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	5.81	□□□□□ -1.48	not detected
YLL058W	YLL058W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	EAF3	Q12432	401 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	LAS17	Q12446	633 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	COA6	Q3E846	104 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	MCM22	P47167	239 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	UBC11	P52492	156 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	NUM1	Q00402	2748 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	PEX7	P39108	375 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	GET2	P40056	285 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YJR015W	P47090	510 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	ERG25	P53045	309 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	SED1	Q01589	338 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	VBA1	Q04301	562 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	SCW10	Q04951	389 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	TDA6	Q06466	467 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YLR302C	O13544	120 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YIL012W	P40551	113 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	CYT2	Q00873	224 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	MRPS16	Q02608	121 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YPR098C	Q06089	161 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YOL118C	Q08259	102 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YOR186W	Q08560	144 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YLR415C	O13578	112 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	RPL39	P04650	51 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	IMP1	P28627	190 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YKL187C	P34231	750 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	MMS2	P53152	137 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	LIP2	Q06005	328 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	SYM1	Q06563	197 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YOR385W	Q08909	290 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YLL058W	YLL058W	VMA3	P25515	160 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	IES6	P32617	166 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	YBR090C	P38253	122 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	SAS2	P40963	338 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	EGT2	P42835	1041 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	RAV2	Q03956	351 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	YPR071W	Q12346	211 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	YLR118C	Q12354	227 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	SPO24	Q3E752	67 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	SPS18	P32572	300 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	SDH4	P37298	181 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	SWD3	P38123	315 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	CUE1	P38428	203 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	ECM14	P38836	430 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	YDL186W	P48568	277 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	UBP8	P50102	471 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	POS5	Q06892	414 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	YOS1	Q3E834	85 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	POP8	P38208	133 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	CTR2	P38865	189 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	GON7	P46984	123 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	LCB3	P47013	409 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	XPT1	P47165	209 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	THI74	Q04083	370 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	PIN3	Q06449	215 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	MLF3	P32047	452 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	CMC1	P36064	111 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	GLE2	P40066	365 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.9 ms