RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR056CYFR056C HTD2P38790 280 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C CYC2P38909 366 aa1.29□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C YJL218WP40892 196 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C LIP1Q03579 150 aa1.29□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C DML1Q03652 475 aa1.29□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C UPS1Q05776 175 aa1.29□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C HRD1Q08109 551 aa1.29□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C ATG41Q12048 136 aa1.29□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C YOR015WQ12169 119 aa1.29□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C YOL162WP0CF19 215 aa1.28□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C STF2P16965 84 aa1.28□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C PHO13P19881 312 aa1.28□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C YEL073CP39974 107 aa1.28□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C GIM4P40005 111 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C YER181CP40097 107 aa1.28□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C NSE4P43124 402 aa1.28□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C YGL204CP53089 101 aa1.28□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C YNR064CP53750 290 aa1.28□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C DAD4P69851 72 aa1.28□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C YDR391CQ04170 232 aa1.28□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C YLR162WQ06235 118 aa1.28□□□□□ -2.2
YFR056CYFR056C MDM35O60200 86 aa1.27□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YEL067CP39978 195 aa1.27□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C MOB1P40484 314 aa1.27□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C RBL2P48606 106 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YGR042WP53227 271 aa1.27□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C GRX5Q02784 150 aa1.27□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YHR007C-AQ07074 71 aa1.27□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YPD1Q07688 167 aa1.27□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C CSI2Q08054 341 aa1.27□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C UIP4Q08926 304 aa1.27□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C RIB3Q99258 208 aa1.27□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C QCR8P08525 94 aa1.26□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C POP7P38291 140 aa1.26□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C ALB1P47019 175 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C EST3Q03096 181 aa1.26□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YHP1Q04116 353 aa1.26□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YMR320WQ04897 101 aa1.26□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C SPC2Q04969 178 aa1.26□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YLR422WQ06409 1932 aa1.26□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C SEN2P16658 377 aa1.25□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C SUI1P32911 108 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C MPM1P40364 252 aa1.25□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C GPI2P46961 280 aa1.25□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C HHO1P53551 258 aa1.25□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YML079WQ03629 201 aa1.25□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YDR102CQ03864 110 aa1.25□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C ELP6Q04868 273 aa1.25□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YPR114WQ06107 315 aa1.25□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YDL241WQ07738 123 aa1.25□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C MRS4P23500 304 aa1.24□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C SRP21P32342 167 aa1.24□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C RPB7P34087 171 aa1.24□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data1.24□□□□□ -2.21not detected
YFR056CYFR056C YPT31P38555 223 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C CCS1P40202 249 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YGR269WP40326 108 aa1.24□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C PAC10P48363 199 aa1.24□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C FMN1Q03778 218 aa1.24□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C ATG10Q07879 167 aa1.24□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C GPA2P10823 449 aa1.23□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C INO4P13902 151 aa1.23□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C AHT1P29589 182 aa1.23□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C RPL13BP40212 199 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C HYR1P40581 163 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C PHB1P40961 287 aa1.23□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YDR366CP87287 132 aa1.23□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C COF1Q03048 143 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C RRT7Q07829 113 aa1.23□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YDL157CQ12082 118 aa1.23□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C SPC3Q12133 184 aa1.23□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YLR361C-AQ3E795 98 aa1.23□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C SPS2P08459 502 aa1.22□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C DDR48P18899 430 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YCL042WP25572 119 aa1.22□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C BAT2P47176 376 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C UBC7Q02159 165 aa1.22□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C RCE1Q03530 315 aa1.22□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C CSN9Q03981 162 aa1.22□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C RFU1Q08003 200 aa1.22□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YMR030W-AQ3E760 96 aa1.22□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa1.22□□□□□ -2.21
YFR056CYFR056C HSP12P22943 109 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C MAK31P23059 88 aa1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C YGL010WP25338 174 aa1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C SUA7P29055 345 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C YBL010CP32788 280 aa1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C PRS3P38689 320 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C YHR140WP38842 239 aa1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C HPA3P39979 161 aa1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C YEL008WP40001 126 aa1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C FLX1P40464 311 aa1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C CIN5P40917 295 aa1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C YAE1P47118 141 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C GEP7P53171 287 aa1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C YGR039WP53225 103 aa1.21□□□□□ -2.22
YFR056CYFR056C AVO2Q04749 426 aa1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms