RNA–Protein interactions for RNA: YER167W

BCK2, Transcript of Serine/threonine-rich protein involved in PKC1 signaling pathway, yeast

Gene BCK2, Length 2,556 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCK2	YER167W	SFT2	P38166	215 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	PHS1	P40857	217 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YGL193C	P53097	103 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YGR164W	P53291	111 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	NRM1	P53718	249 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YPL039W	Q03080	316 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	FIT3	Q08907	204 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	MED11	Q99278	115 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	NUP159	P40477	1460 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YCR006C	P25350	157 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	CAT5	P41735	233 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	EAF6	P47128	113 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	SCW11	P53189	542 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	ROT1	Q03691	256 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	INO4	P13902	151 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	VMA11	P32842	164 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	USV1	Q12132	391 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	ATG5	Q12380	294 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	NPC2	Q12408	173 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	DNA2	P38859	1522 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	MAK32	P23060	363 aa		3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	CSE2	P33308	149 aa		3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	TIR3	P40552	269 aa		3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	FIT1	Q04433	528 aa		3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	ULS1	Q08562	1619 aa		3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	MSW1	P04803	379 aa		3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	MIG1	P27705	504 aa		3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		3.31	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YCR025C	P25352	136 aa		3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	AVT7	P40501	490 aa		3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YFL065C	P43539	102 aa		3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	EMC4	P53073	190 aa		3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	EST3	Q03096	181 aa		3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	MIM1	Q08176	113 aa		3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YPR203W	Q08994	102 aa		3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	LYS5	P50113	272 aa		3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.3	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	ERG4	P25340	473 aa		3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	PAI3	P01094	68 aa		3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	MTC6	P38849	526 aa		3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	IRC20	Q06554	1556 aa		3.29	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	ECM12	O13529	151 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YAR066W	P0CX18	203 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YHR214W	P0CX19	203 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YGL010W	P25338	174 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YMC2	P38087	329 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	SMP1	P38128	452 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	CWP2	P43497	92 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	TRP1	P00912	224 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	AGA1	P32323	725 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	SYS1	P41544	203 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YLR281C	Q05863	155 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	CSI2	Q08054	341 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	ATO3	Q12359	275 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BCK2	YER167W	TOD6	P34219	525 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BCK2	YER167W	SAP30	P38429	201 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BCK2	YER167W	NSG1	P38837	291 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BCK2	YER167W	SDS23	P53172	527 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BCK2	YER167W	STU1	P38198	1513 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BCK2	YER167W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.27	□□□□□ -1.89	not detected
BCK2	YER167W	LPP1	Q04396	274 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BCK2	YER167W	ANT1	Q06497	328 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BCK2	YER167W	RAF1	Q06891	181 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BCK2	YER167W	PRM3	Q08931	133 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BCK2	YER167W	YPL264C	Q08980	353 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BCK2	YER167W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BCK2	YER167W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89

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