RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 ENPEPQ07075 957 aa23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 CETN1Q12798 172 aa23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 MEI1Q5TIA1 1274 aa23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 GJB7Q6PEY0 223 aa23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 ZPBP2Q6X784 338 aa23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 SLC30A5Q8TAD4 765 aa23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 COG1Q8WTW3 980 aa23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 SYT11Q9BT88 431 aa23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 CDT1Q9H211 546 aa23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 PTPRHQ9HD43 1115 aa23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 CLDND1Q9NY35 253 aa23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 TBX20Q9UMR3 447 aa23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 CES2O00748 559 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 B4GALT3O60512 393 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 PALMO75781 387 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 THP07101 528 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 MCF2P10911 925 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 LIG4P49917 911 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 HYAL1Q12794 435 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 GRIK3Q13003 919 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 HDXQ7Z353 690 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 VPS52Q8N1B4 723 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 GSTCDQ8NEC7 633 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 KCNN1Q92952 543 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 ASB2Q96Q27 587 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 CBWD1Q9BRT8 395 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 PACSIN1Q9BY11 444 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 GPR88Q9GZN0 384 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
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SGMS1-210ENST00000619438 NRIP1P48552 1158 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 FAM193AP78312 1265 aa23■■□□□ 1.27
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SGMS1-210ENST00000619438 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 OLIG1Q8TAK6 271 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 ACAP3Q96P50 834 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 COLEC11Q9BWP8 271 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 ABCB6Q9NP58 842 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 MUC3AQ02505 3323 aa22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.279e-9■■□□□ 14.4
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SGMS1-210ENST00000619438 PER2O15055 1255 aa22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 CXCL14O95715 111 aa22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 GRM5P41594 1212 aa22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 CEP120Q8N960 986 aa22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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SGMS1-210ENST00000619438 PROZP22891 400 aa22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 PAFAH1B1P43034 410 aa22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 DSC1Q08554 894 aa22.98■■□□□ 1.27
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SGMS1-210ENST00000619438 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 H2AFVQ71UI9 128 aa22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 STK39Q9UEW8 545 aa22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 MAP9Q49MG5 647 aa22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 TISP43B9A030 160 aa22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 FSCN2O14926 492 aa22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 KCNQ1P51787 676 aa22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 DLG4P78352 724 aa22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 PPP3CAQ08209 521 aa22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 TUSC3Q13454 348 aa22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC181Q5TID7 509 aa22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 RDH13Q8NBN7 331 aa22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 FBXL18Q96ME1 805 aa22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 HIDE1A8MVS5 230 aa22.96■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 PTGESO14684 152 aa22.96■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 TADA2AO75478 443 aa22.96■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 SEZ6Q53EL9 994 aa22.96■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.96■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.96■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.96■■□□□ 1.27
SGMS1-210ENST00000619438 TTC28Q96AY4 2481 aa22.95■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.95■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 ABLIM1O14639 778 aa22.95■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 ADSSP30520 456 aa22.95■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 NDUFV1P49821 464 aa22.95■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 MCL1Q07820 350 aa22.95■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.95■■□□□ 1.26
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