RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615065.1

PRKN-211, Transcript of parkin RBR E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PRKN, Length 261 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKN-211ENST00000615065 ASIC1P78348 528 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 CYP4F8P98187 520 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 BFSP1Q12934 665 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 VEPH1Q14D04 833 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 GPR158Q5T848 1215 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 GPD1LQ8N335 351 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 GIPC2Q8TF65 315 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 SEMA4AQ9H3S1 761 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 TMLHEQ9NVH6 421 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 SIX4Q9UIU6 781 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 L1RE1Q9UN81 338 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRKN-211ENST00000615065 PTPRJQ12913 1337 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 MAN2B1O00754 1011 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 NCAM2O15394 837 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 CUTAO60888 179 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 FGF19O95750 216 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 HOXD13P35453 343 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 SMARCB1Q12824 385 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 HSCBQ8IWL3 235 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 YAF2Q8IY57 180 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 LRRC52Q8N7C0 313 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 E2F7Q96AV8 911 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 LRRC3BQ96PB8 259 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 CUEDC2Q9H467 287 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 IL21Q9HBE4 155 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 FBXO4Q9UKT5 387 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 ITGA11Q9UKX5 1188 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa15.95■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 CHADO15335 359 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 HUS1O60921 280 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 PRAMEF12O95522 483 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 KRT19P08727 400 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 TMEM191BP0C7N4 346 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 GPR15P49685 360 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 TSPY1Q01534 308 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 FCHO2Q0JRZ9 810 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 ZNF528Q3MIS6 628 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 OSTM1Q86WC4 334 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 CBWD2Q8IUF1 395 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 IQUBQ8NA54 791 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 STKLD1Q8NE28 680 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 FAM3CQ92520 227 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 PI4K2AQ9BTU6 479 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 SNX9Q9Y5X1 595 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 SPTBN4Q9H254 2564 aa15.94■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 SLC38A8A6NNN8 435 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 DPYSL4O14531 572 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 HCRTO43612 131 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 F13A1P00488 732 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 CCNE1P24864 410 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 CASP1P29466 404 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 CDC25CP30307 473 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 SOX9P48436 509 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 RBP5P82980 135 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 AMPD3Q01432 767 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 MTAPQ13126 283 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 PKP1Q13835 747 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 TAF12Q16514 161 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 CCDC142Q17RM4 750 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 FAM26FQ5R3K3 315 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 CNNM4Q6P4Q7 775 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 TSSK4Q6SA08 328 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 GCNAQ96QF7 691 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 CHRDQ9H2X0 955 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 TASP1Q9H6P5 420 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 INTS13Q9NVM9 706 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 HSPBP1Q9NZL4 362 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 ZNF292O60281 2723 aa15.93■□□□□ 0.14
PRKN-211ENST00000615065 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms