RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
CTU2-210ENST00000567949 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.7■■□□□ 1.07
CTU2-210ENST00000567949 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.7■■□□□ 1.07
CTU2-210ENST00000567949 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.7■■□□□ 1.07
CTU2-210ENST00000567949 KLK14Q9P0G3 267 aa21.7■■□□□ 1.07
CTU2-210ENST00000567949 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
CTU2-210ENST00000567949 ESYT3A0FGR9 886 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 XPOTO43592 962 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 MICAL2O94851 1124 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 HMGCRP04035 888 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CARSP49589 748 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 PAK2Q13177 524 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 KCNA10Q16322 511 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 SGO2Q562F6 1265 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 RPAINQ86UA6 219 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 C3orf20Q8ND61 904 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 O00370 1275 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 PSTPIP1O43586 416 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 IFT81Q8WYA0 676 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 WNT8BQ93098 351 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 PIRO00625 290 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CAVIN3Q969G5 261 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 RNF19AQ9NV58 838 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 SRRDQ9UH36 339 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 PHF2O75151 1096 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 RPS6KA5O75582 802 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 PRELID2Q8N945 189 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 C18orf8Q96DM3 657 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 MCEEQ96PE7 176 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 NFU1Q9UMS0 254 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 SCN1AP35498 2009 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 M0QYV0 167 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 TTI1O43156 1089 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CHRNA1P02708 482 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CYP3A5P20815 502 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 HOXD10P28358 340 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 TAS2R40P59535 323 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 MGAT3Q09327 533 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 NNTQ13423 1086 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CPXM1Q96SM3 734 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 ACBD3Q9H3P7 528 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 FSCN2O14926 492 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CHRNA3P32297 505 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 GPD2P43304 727 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 GPS2Q13227 327 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CUL1Q13616 776 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 STILQ15468 1287 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 TRADDQ15628 312 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CYP1B1Q16678 543 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 ZNF560Q96MR9 790 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CHST12Q9NRB3 414 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 USTQ9Y2C2 406 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa21.66■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.66■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 CTSHP09668 335 aa21.66■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 PNPLA4P41247 253 aa21.66■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 DR1Q01658 176 aa21.66■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.66■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 KATNAL2Q8IYT4 538 aa21.66■■□□□ 1.06
CTU2-210ENST00000567949 SEC14L1Q92503 715 aa21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms