RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 NACC2Q96BF6 587 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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PTPRB-210ENST00000551525 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRB-210ENST00000551525 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC1A1P43005 524 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRB-210ENST00000551525 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SLC9A6Q92581 669 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRB-210ENST00000551525 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CNDP1Q96KN2 507 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 DYRK4Q9NR20 520 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.59□□□□□ -1.35
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PTPRB-210ENST00000551525 AKAP14Q86UN6 197 aa6.59□□□□□ -1.35
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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PTPRB-210ENST00000551525 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CYP4A11Q02928 519 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 GALNT7Q86SF2 657 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 LUZP2Q86TE4 346 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 KCNB2Q92953 911 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 YME1L1Q96TA2 773 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MYL10Q9BUA6 226 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.59□□□□□ -1.35
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