RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543754.1

PUS1-209, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PUS1, Length 1,378 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-209ENST00000543754 EXTL3O43909 919 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 PIGRP01833 764 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 RETP07949 1114 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 NFICP08651 508 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 CLTAP09496 248 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 WNT7BP56706 349 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 LILRA4P59901 499 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 GTF2BQ00403 316 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 CCINQ13939 588 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 CCDC6Q16204 474 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 GPR158Q5T848 1215 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 SPATA1Q5VX52 437 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 JADE1Q6IE81 842 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 ELMOD1Q8N336 334 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 IQUBQ8NA54 791 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 PSMG2Q969U7 264 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 FAM84AQ96KN4 292 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 SENP8Q96LD8 212 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 TSPAN18Q96SJ8 248 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 TNMDQ9H2S6 317 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 MAFFQ9ULX9 164 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 TBX20Q9UMR3 447 aa11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 A0A0B4J269 797 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 ANTXRLA6NF34 631 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 CYP3A5P20815 502 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 GABRR2P28476 465 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 LIG4P49917 911 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 NRLP54845 237 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 AMPD3Q01432 767 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 ALCAMQ13740 583 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 PPM1JQ5JR12 505 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 OVOS1Q6IE37 1185 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 LEMD2Q8NC56 503 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 BICD1Q96G01 975 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 IER2Q9BTL4 223 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 SLC46A2Q9BY10 475 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 ATXN3LQ9H3M9 355 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 HPS4Q9NQG7 708 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 TMLHEQ9NVH6 421 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 CCL26Q9Y258 94 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 GREB1Q4ZG55 1949 aa11.88□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 ANO9A1A5B4 782 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 MYMKA6NI61 221 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 OR6C75A6NL08 312 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 PIRO00625 290 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 TYMPP19971 482 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 NMT1P30419 496 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 ME1P48163 572 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 GPR15P49685 360 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 EPHB3P54753 998 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 PKP1Q13835 747 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 MYBPC2Q14324 1141 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 CSRP2Q16527 193 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 CCDC142Q17RM4 750 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 TRIM68Q6AZZ1 485 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 FSTL4Q6MZW2 842 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 LONP2Q86WA8 852 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 GIPC2Q8TF65 315 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 SPAG17Q6Q759 2223 aa11.87□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11.86□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.86□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 TM4SF5O14894 197 aa11.86□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 OGTO15294 1046 aa11.86□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 CYP11A1P05108 521 aa11.86□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PUS1-209ENST00000543754 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms