RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 POTECB2RU33 542 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CAPN9O14815 690 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 NPTXRO95502 500 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TNFRSF8P28908 595 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 LLGL1Q15334 1064 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 PCGF5Q86SE9 256 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CD302Q8IX05 232 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 C12orf42Q96LP6 360 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TRIM16O95361 564 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 DPEP1P16444 411 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 HMOX2P30519 316 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CHRNA3P32297 505 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 GALK1P51570 392 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 DSG1Q02413 1049 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CNGA3Q16281 694 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 LDHDQ86WU2 507 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TBATAQ96M53 351 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MTFR1LQ9H019 292 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 NR2F2P24468 414 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 USP46P62068 366 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 GPRASP2Q96D09 838 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 H0Y626 953 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MED24O75448 989 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 SPAG6O75602 509 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CFBP00751 764 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 PYGMP11217 842 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 NAT1P18440 290 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CA4P22748 312 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 STAT1P42224 750 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MCL1Q07820 350 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MTA1Q13330 715 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF398Q8TD17 642 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MPP6Q9NZW5 540 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 MAP2K7O14733 419 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CACNB3P54284 484 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 ERICH1Q86X53 443 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 VMP1Q96GC9 406 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MBD2Q9UBB5 411 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 EDIL3O43854 480 aa6.34□□□□□ -1.39
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