RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBX20Q9UMR3 447 aa11.15□□□□□ -0.62
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASB3Q9Y575 518 aa11.14□□□□□ -0.63
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF33AQ06730 810 aa11.13□□□□□ -0.63
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa11.13□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SFTPA1Q8IWL2 248 aa11.13□□□□□ -0.63
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.13□□□□□ -0.63
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RARRES1P49788 294 aa11.12□□□□□ -0.63
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BSNDQ8WZ55 320 aa11.12□□□□□ -0.63
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.12□□□□□ -0.63
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPN13Q12923 2485 aa11.12□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIP11Q15643 1979 aa11.11□□□□□ -0.63
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBFA2T3O75081 653 aa11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GJB3O75712 270 aa11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT10P13645 584 aa11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP2B1P20020 1258 aa11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL9P32969 192 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPA4P34932 840 aa11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXD12P35452 270 aa11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFNAR2P48551 515 aa11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAMK2BQ13554 666 aa11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTF1Q14872 753 aa11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NECTIN1Q15223 517 aa11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPDYCQ5MJ68 293 aa11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EMC10Q5UCC4 262 aa11.11□□□□□ -0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MOXD1Q6UVY6 613 aa11.11□□□□□ -0.63
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