RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CAGE1Q8TC20 777 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 SAAL1Q96ER3 474 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CPB2Q96IY4 423 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 SCLT1Q96NL6 688 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TRIM5Q9C035 493 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CDT1Q9H211 546 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 VPS16Q9H269 839 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 C11orf49Q9H6J7 331 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 GINS2Q9Y248 185 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TRIP11Q15643 1979 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.65□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 CITO14578 2027 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 CEP290O15078 2479 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF233A6NK53 670 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 LGALS16A8MUM7 142 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 CBFA2T2O43439 604 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 NDUFB5O43674 189 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 RPS6KA5O75582 802 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 TPM3P06753 285 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 CTSHP09668 335 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 ACOT2P49753 483 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 VAMP7P51809 220 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 CYP24A1Q07973 514 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 FAAP100Q0VG06 881 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 BFSP1Q12934 665 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 BFSP2Q13515 415 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 DSC3Q14574 896 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 UBXN11Q5T124 520 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 NOTUMQ6P988 496 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 USP38Q8NB14 1042 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 SLC35C1Q96A29 364 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 CCDC51Q96ER9 411 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 TCHPQ9BT92 498 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 NDST4Q9H3R1 872 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 CHST12Q9NRB3 414 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 SCN5AQ14524 2016 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 GPR182O15218 404 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 PMM2O15305 246 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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CMTM1-220ENST00000534143 NPTXRO95502 500 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 CLTAP09496 248 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 GHRP10912 638 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 KRT13P13646 458 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 CD52P31358 61 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 TNFSF9P41273 254 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 DLG4P78352 724 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 PPP3CAQ08209 521 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 PSMD6Q15008 389 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 SURF1Q15526 300 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 KYAT1Q16773 422 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 LRRC26Q2I0M4 334 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM1-220ENST00000534143 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.63□□□□□ -1.35
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